242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0496 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  43.33 
 
 		 1229 aa  1113    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  34.04 
 
 		 1258 aa  700    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  48.27 
 
 		 1343 aa  720    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.74 
 
 		 1152 aa  702    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  35.46 
 
 		 1259 aa  689    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  34.44 
 
 		 1426 aa  661    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  55.74 
 
 		 1293 aa  1453    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  37.1 
 
 		 1250 aa  704    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  31.68 
 
 		 1255 aa  641    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0292  CobN/magnesium chelatase  45.19 
 
 		 1239 aa  1121    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.431661  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  33.81 
 
 		 1220 aa  674    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  53.72 
 
 		 1285 aa  1407    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1022  Cobaltochelatase  36.57 
 
 		 1250 aa  703    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.550744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  36.8 
 
 		 1237 aa  677    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  35.82 
 
 		 1291 aa  816    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  35.73 
 
 		 1244 aa  756    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  49.69 
 
 		 1192 aa  1224    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  52.99 
 
 		 1266 aa  1405    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  100 
 
 		 1270 aa  2609    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  35.73 
 
 		 1256 aa  704    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  59.35 
 
 		 1297 aa  1584    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  34.36 
 
 		 1406 aa  637    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  34.25 
 
 		 1206 aa  643    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  33.75 
 
 		 1238 aa  631  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  33.91 
 
 		 1193 aa  632  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  33.47 
 
 		 1207 aa  629  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  33.83 
 
 		 1266 aa  624  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  33.47 
 
 		 1222 aa  624  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  32.83 
 
 		 1199 aa  625  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  33.47 
 
 		 1453 aa  625  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  32.86 
 
 		 1222 aa  616  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  34.54 
 
 		 1409 aa  618  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  34.47 
 
 		 1196 aa  616  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  33.42 
 
 		 1302 aa  613  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  33.55 
 
 		 1444 aa  610  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  33.47 
 
 		 1190 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  33.28 
 
 		 1191 aa  611  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  32.52 
 
 		 1209 aa  599  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  32.13 
 
 		 1263 aa  600  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  32.63 
 
 		 1198 aa  602  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  32.72 
 
 		 1198 aa  601  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  32.72 
 
 		 1198 aa  601  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  32.75 
 
 		 1205 aa  601  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  32.65 
 
 		 1298 aa  597  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  31.83 
 
 		 1212 aa  597  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  32.07 
 
 		 1435 aa  595  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  32.83 
 
 		 1213 aa  593  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  33.03 
 
 		 1194 aa  586  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  33.42 
 
 		 1207 aa  586  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  32.65 
 
 		 1203 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  33.58 
 
 		 1281 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  32.91 
 
 		 1253 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  32.33 
 
 		 1253 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  32.16 
 
 		 1253 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  32.15 
 
 		 1253 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  30.94 
 
 		 1293 aa  575  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  33.67 
 
 		 1281 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  32.99 
 
 		 1364 aa  571  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  33.28 
 
 		 1248 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  30.72 
 
 		 1253 aa  572  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  32.35 
 
 		 1254 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  33.77 
 
 		 1281 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  32.14 
 
 		 1248 aa  566  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  32.83 
 
 		 1267 aa  566  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  32.16 
 
 		 1254 aa  562  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  33.51 
 
 		 1267 aa  561  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  32.94 
 
 		 1248 aa  562  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  30.97 
 
 		 1288 aa  562  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  33.28 
 
 		 1278 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  32.27 
 
 		 1270 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  28.98 
 
 		 1244 aa  555  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  32.07 
 
 		 1257 aa  555  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  32.35 
 
 		 1269 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  31.93 
 
 		 1270 aa  555  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  32.11 
 
 		 1269 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  32.11 
 
 		 1269 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  32.85 
 
 		 1273 aa  552  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  30.82 
 
 		 1261 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  31.57 
 
 		 1304 aa  550  1e-155  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  30.79 
 
 		 1247 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  30.93 
 
 		 1247 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  32.21 
 
 		 1240 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  30.57 
 
 		 1290 aa  539  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  32.35 
 
 		 1273 aa  521  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  31.44 
 
 		 1328 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  32.23 
 
 		 1243 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  31.79 
 
 		 1300 aa  510  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  30.45 
 
 		 1330 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  33.85 
 
 		 1235 aa  507  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  31.3 
 
 		 1247 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  30.87 
 
 		 1274 aa  500  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  32.07 
 
 		 1187 aa  501  1e-140  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  32.13 
 
 		 1187 aa  500  1e-140  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  31.58 
 
 		 1263 aa  498  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  30.93 
 
 		 1260 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  32.79 
 
 		 1249 aa  499  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  30.42 
 
 		 1329 aa  497  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  31.08 
 
 		 1263 aa  495  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  31.12 
 
 		 1283 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09821  cobalamin biosynthetic protein CobN  27.51 
 
 		 1245 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>