241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0434 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  37.29 
 
 
1253 aa  801    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  36.86 
 
 
1220 aa  741    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  35.86 
 
 
1244 aa  810    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  40.07 
 
 
1193 aa  890    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  35.58 
 
 
1263 aa  746    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  36.4 
 
 
1254 aa  808    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  36.86 
 
 
1220 aa  741    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  36.72 
 
 
1254 aa  811    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  40.25 
 
 
1209 aa  880    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.81 
 
 
1262 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  34.25 
 
 
1235 aa  692    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  36.57 
 
 
1247 aa  822    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  35.28 
 
 
1343 aa  763    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  35.67 
 
 
1263 aa  749    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  40.78 
 
 
1304 aa  929    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  42.49 
 
 
1409 aa  914    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  36.72 
 
 
1288 aa  837    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  37.03 
 
 
1273 aa  767    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  37.61 
 
 
1261 aa  833    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  36.04 
 
 
1281 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  38.02 
 
 
1257 aa  828    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  42.11 
 
 
1453 aa  928    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  39.4 
 
 
1213 aa  886    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  35.99 
 
 
1269 aa  787    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  33.02 
 
 
1229 aa  689    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  37.12 
 
 
1175 aa  753    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  46.94 
 
 
1259 aa  1182    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  39.46 
 
 
1266 aa  917    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  37.97 
 
 
1293 aa  798    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  41.14 
 
 
1426 aa  990    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  35.71 
 
 
1249 aa  710    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  34.43 
 
 
1273 aa  721    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0921  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.82 
 
 
1245 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.308916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  37.12 
 
 
1267 aa  806    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  36.14 
 
 
1263 aa  832    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  36.08 
 
 
1269 aa  793    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  38.41 
 
 
1253 aa  827    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  36.58 
 
 
1240 aa  757    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  36.54 
 
 
1278 aa  789    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  41.41 
 
 
1364 aa  845    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  34.18 
 
 
1286 aa  680    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  36.08 
 
 
1247 aa  811    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  41.76 
 
 
1222 aa  942    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  43.02 
 
 
1255 aa  990    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0292  CobN/magnesium chelatase  35.68 
 
 
1239 aa  704    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.431661  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  48.61 
 
 
1258 aa  1223    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  35.81 
 
 
1269 aa  788    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  35.88 
 
 
1263 aa  749    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  37.86 
 
 
1248 aa  833    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  38.83 
 
 
1198 aa  864    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  36.72 
 
 
1267 aa  808    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  34.9 
 
 
1291 aa  723    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  41.01 
 
 
1406 aa  936    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  35.33 
 
 
1247 aa  685    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  37.84 
 
 
1248 aa  813    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  39.3 
 
 
1444 aa  927    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  31.46 
 
 
1245 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  35.85 
 
 
1269 aa  791    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  38.92 
 
 
1198 aa  865    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  44.65 
 
 
1237 aa  1043    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  35.14 
 
 
1363 aa  771    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  43.04 
 
 
1220 aa  1053    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  38.59 
 
 
1199 aa  855    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  36.64 
 
 
1270 aa  798    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  38.32 
 
 
1248 aa  819    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  37.8 
 
 
1293 aa  811    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  35.85 
 
 
1269 aa  791    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  100 
 
 
1244 aa  2553    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  35.81 
 
 
1192 aa  714    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  40 
 
 
1238 aa  906    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  35 
 
 
1260 aa  737    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  37.51 
 
 
1266 aa  801    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  35.73 
 
 
1270 aa  756    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  37.38 
 
 
1253 aa  802    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  49.06 
 
 
1256 aa  1236    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  34.11 
 
 
1297 aa  686    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  37.8 
 
 
1285 aa  782    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  37 
 
 
1253 aa  847    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  36.43 
 
 
1270 aa  795    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  38.52 
 
 
1330 aa  727    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  38.32 
 
 
1190 aa  857    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  41.14 
 
 
1302 aa  973    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  38.92 
 
 
1198 aa  865    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  39.61 
 
 
1205 aa  898    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  36.77 
 
 
1220 aa  739    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  39.78 
 
 
1435 aa  935    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09821  cobalamin biosynthetic protein CobN  32.06 
 
 
1245 aa  640    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  36.28 
 
 
1269 aa  808    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  37.64 
 
 
1253 aa  804    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  31.15 
 
 
1245 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  31.7 
 
 
1262 aa  668    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  42.34 
 
 
1222 aa  939    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  39.19 
 
 
1212 aa  871    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  32.27 
 
 
1259 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  36.86 
 
 
1220 aa  741    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  33.74 
 
 
1253 aa  692    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327208 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.95 
 
 
1152 aa  679    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  38.27 
 
 
1194 aa  860    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  36.04 
 
 
1281 aa  791    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  36.04 
 
 
1281 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>