241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2089 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  32.57 
 
 		 1291 aa  695    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  35.81 
 
 		 1285 aa  711    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  35.86 
 
 		 1229 aa  717    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  36.72 
 
 		 1293 aa  726    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  34.95 
 
 		 1244 aa  679    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  37.34 
 
 		 1192 aa  700    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  35.67 
 
 		 1266 aa  741    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  34.74 
 
 		 1270 aa  702    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  100 
 
 		 1152 aa  2352    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0292  CobN/magnesium chelatase  33.75 
 
 		 1239 aa  627  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.431661  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  32.73 
 
 		 1256 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  32.64 
 
 		 1259 aa  595  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  33.1 
 
 		 1258 aa  590  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  32.31 
 
 		 1250 aa  587  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1022  Cobaltochelatase  32.33 
 
 		 1250 aa  579  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.550744  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  32.49 
 
 		 1255 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  33.19 
 
 		 1406 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  31.03 
 
 		 1435 aa  572  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  31.57 
 
 		 1237 aa  572  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  29.97 
 
 		 1288 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  31.48 
 
 		 1220 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  29.74 
 
 		 1263 aa  553  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  31.13 
 
 		 1261 aa  556  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  29.88 
 
 		 1290 aa  550  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  30.74 
 
 		 1248 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  30.57 
 
 		 1270 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  30.71 
 
 		 1253 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  30.37 
 
 		 1253 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  31.38 
 
 		 1191 aa  535  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  30.79 
 
 		 1269 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  30.79 
 
 		 1269 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  30.3 
 
 		 1253 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  30.53 
 
 		 1213 aa  533  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  30.22 
 
 		 1253 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  29.64 
 
 		 1293 aa  530  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  29.67 
 
 		 1207 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  30.62 
 
 		 1206 aa  527  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  30.06 
 
 		 1266 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  30.13 
 
 		 1273 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  29.77 
 
 		 1205 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  30.48 
 
 		 1198 aa  522  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  30.15 
 
 		 1254 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  29.15 
 
 		 1222 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  30.48 
 
 		 1198 aa  522  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  30.48 
 
 		 1198 aa  522  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  30.39 
 
 		 1278 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  28.73 
 
 		 1244 aa  513  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  31.2 
 
 		 1194 aa  514  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  29.71 
 
 		 1193 aa  516  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  30.15 
 
 		 1257 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  31.16 
 
 		 1190 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  29.76 
 
 		 1240 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  29.49 
 
 		 1199 aa  501  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  29.72 
 
 		 1209 aa  499  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  28.85 
 
 		 1212 aa  497  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  29.11 
 
 		 1207 aa  495  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  30.13 
 
 		 1253 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  29.58 
 
 		 1203 aa  482  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  33.33 
 
 		 1187 aa  481  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  33.18 
 
 		 1187 aa  479  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  30.06 
 
 		 1245 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  29.65 
 
 		 1263 aa  478  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  29.96 
 
 		 1263 aa  479  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  29.56 
 
 		 1263 aa  475  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  30.89 
 
 		 1235 aa  474  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  30.94 
 
 		 1242 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  30.49 
 
 		 1175 aa  466  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  30.85 
 
 		 1248 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  28.63 
 
 		 1758 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09821  cobalamin biosynthetic protein CobN  29.11 
 
 		 1245 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  28.81 
 
 		 1245 aa  462  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  30.19 
 
 		 1247 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  30.37 
 
 		 1551 aa  457  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0921  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.96 
 
 		 1245 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.308916  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  28.33 
 
 		 1283 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  29.73 
 
 		 1538 aa  452  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  30.5 
 
 		 1248 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  28.46 
 
 		 1300 aa  451  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3507  cobaltochelatase, CobN subunit  28.76 
 
 		 1104 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11583  normal  0.546877 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  30.49 
 
 		 1340 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  27.9 
 
 		 1253 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  28.1 
 
 		 2110 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  29.31 
 
 		 1277 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  29.31 
 
 		 1333 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  28.08 
 
 		 2168 aa  446  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  29.74 
 
 		 1249 aa  446  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  30.31 
 
 		 1323 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  29.72 
 
 		 1248 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  28.51 
 
 		 1238 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  28.86 
 
 		 1275 aa  439  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  28.75 
 
 		 1238 aa  439  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  28.36 
 
 		 1245 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  29.03 
 
 		 1243 aa  436  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  29.82 
 
 		 1727 aa  432  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  31.21 
 
 		 1210 aa  432  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  28.18 
 
 		 1249 aa  430  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  28.94 
 
 		 1261 aa  428  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  28.92 
 
 		 1242 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  26.65 
 
 		 1267 aa  421  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  29.83 
 
 		 1244 aa  422  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>