242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3507 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2827  cobaltochelatase subunit CobN  45.56 
 
 		 1078 aa  796    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1518  cobaltochelatase subunit CobN  45.21 
 
 		 1078 aa  810    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0624953  normal  0.136834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3286  cobaltochelatase subunit CobN  47.02 
 
 		 1126 aa  842    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201105  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0342  cobaltochelatase subunit CobN  44.6 
 
 		 1094 aa  801    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2931  cobaltochelatase subunit CobN  44.06 
 
 		 1090 aa  835    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.347121  hitchhiker  0.00673529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1889  cobaltochelatase subunit CobN  44.56 
 
 		 1108 aa  832    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2210  cobaltochelatase subunit CobN  44 
 
 		 1081 aa  781    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3115  cobaltochelatase subunit CobN  47.26 
 
 		 1109 aa  811    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3144  cobaltochelatase subunit CobN  46.79 
 
 		 1140 aa  855    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1439  cobaltochelatase subunit CobN  45.91 
 
 		 1143 aa  822    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.293615  normal  0.816429 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3268  cobaltochelatase, CobN subunit  56.83 
 
 		 1115 aa  1179    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0228816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2532  cobaltochelatase subunit CobN  43.32 
 
 		 1056 aa  786    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2438  cobaltochelatase subunit CobN  47.68 
 
 		 1099 aa  758    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.621018  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1714  cobaltochelatase subunit CobN  45.91 
 
 		 1143 aa  816    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185329  decreased coverage  0.00608846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2149  cobaltochelatase subunit CobN  46.62 
 
 		 1103 aa  777    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304993  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1436  cobaltochelatase subunit CobN  46.15 
 
 		 1144 aa  830    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11738  normal  0.80922 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1468  cobaltochelatase subunit CobN  45.74 
 
 		 1078 aa  799    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3507  cobaltochelatase, CobN subunit  100 
 
 		 1104 aa  2236    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11583  normal  0.546877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  40.67 
 
 		 1273 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  41.36 
 
 		 1260 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  39.44 
 
 		 1263 aa  488  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  39.44 
 
 		 1263 aa  489  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  39.36 
 
 		 1235 aa  482  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  38.36 
 
 		 1263 aa  478  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  40.87 
 
 		 1240 aa  478  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  40.17 
 
 		 1249 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.76 
 
 		 1152 aa  451  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  38.7 
 
 		 1281 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  38.7 
 
 		 1281 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  38.24 
 
 		 1269 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  35.43 
 
 		 1290 aa  443  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  38.7 
 
 		 1281 aa  446  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  36.44 
 
 		 1254 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  36.25 
 
 		 1269 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  39.51 
 
 		 1286 aa  443  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  37.69 
 
 		 1253 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  34.82 
 
 		 1288 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  36.65 
 
 		 1267 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  37.5 
 
 		 1257 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  37.13 
 
 		 1253 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  36.16 
 
 		 1254 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  37.83 
 
 		 1269 aa  436  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  36.17 
 
 		 1267 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  39.66 
 
 		 1247 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  37.59 
 
 		 1270 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  37.59 
 
 		 1270 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  37.13 
 
 		 1253 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  37.36 
 
 		 1248 aa  432  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  37.45 
 
 		 1269 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  37.81 
 
 		 1269 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  37.81 
 
 		 1269 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  37.27 
 
 		 1253 aa  433  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  36.06 
 
 		 1247 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  35.93 
 
 		 1247 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  35.66 
 
 		 1261 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  37.46 
 
 		 1248 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  36.63 
 
 		 1293 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  38.14 
 
 		 1278 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  37.42 
 
 		 1273 aa  422  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  37.41 
 
 		 1263 aa  419  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2900  cobaltochelatase, CobN subunit  37.03 
 
 		 1348 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  37.75 
 
 		 1248 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  37.08 
 
 		 1220 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  37.08 
 
 		 1220 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  37.08 
 
 		 1220 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  37.08 
 
 		 1220 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  29.64 
 
 		 1192 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  26.93 
 
 		 1229 aa  404  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  33.09 
 
 		 1363 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2371  cobaltochelatase subunit CobN  46.59 
 
 		 1388 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408289  normal  0.0205166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  48.33 
 
 		 1330 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  32.72 
 
 		 1253 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  29.45 
 
 		 1366 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  28.37 
 
 		 1340 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  28.56 
 
 		 1323 aa  364  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  28.15 
 
 		 1318 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  33.58 
 
 		 1237 aa  348  4e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  30.21 
 
 		 1234 aa  347  8e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1121  cobaltochelatase, CobN subunit  33.57 
 
 		 1256 aa  343  1e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229116  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  28.54 
 
 		 1247 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  29.21 
 
 		 1242 aa  337  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  29.07 
 
 		 1193 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  27.18 
 
 		 1727 aa  337  7e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  30.12 
 
 		 1238 aa  336  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  29.62 
 
 		 1238 aa  334  7.000000000000001e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  32.14 
 
 		 1259 aa  333  9e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  28.74 
 
 		 1197 aa  333  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  28.22 
 
 		 1248 aa  330  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1357  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.33 
 
 		 1242 aa  330  9e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.250832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  28.15 
 
 		 1248 aa  329  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0626  cobalamin biosynthesis protein  34.78 
 
 		 1379 aa  327  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.941257 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  29.55 
 
 		 1193 aa  327  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  29.8 
 
 		 1193 aa  326  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  27.68 
 
 		 1248 aa  326  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  28.9 
 
 		 1241 aa  321  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  31.12 
 
 		 1426 aa  320  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  29.76 
 
 		 1173 aa  320  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  29.69 
 
 		 1194 aa  320  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  28.07 
 
 		 1262 aa  319  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  28.57 
 
 		 1245 aa  318  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>