241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3731 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  41.38 
 
 		 1442 aa  1005    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  40.51 
 
 		 1504 aa  973    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 		 1538 aa  3160    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  48.05 
 
 		 2168 aa  1296    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  33.93 
 
 		 1318 aa  667    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  35.02 
 
 		 1323 aa  722    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  38.94 
 
 		 1738 aa  849    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2260  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  37.7 
 
 		 1750 aa  843    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0356952  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  48.91 
 
 		 2110 aa  1314    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  47.43 
 
 		 1758 aa  1306    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  39.36 
 
 		 1812 aa  904    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  36.29 
 
 		 1340 aa  735    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  41.41 
 
 		 1727 aa  872    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  34.09 
 
 		 1366 aa  724    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  41.43 
 
 		 1579 aa  866    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  41.03 
 
 		 1551 aa  884    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  32.78 
 
 		 1336 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  33.1 
 
 		 1300 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  32.79 
 
 		 1281 aa  550  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  32.79 
 
 		 1281 aa  550  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1795  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  43.43 
 
 		 2113 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  30.92 
 
 		 1220 aa  513  1e-144  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  29.82 
 
 		 1255 aa  502  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  29.84 
 
 		 1426 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  30.07 
 
 		 1258 aa  485  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.22 
 
 		 2065 aa  483  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  29.92 
 
 		 1244 aa  483  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  31.1 
 
 		 1266 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  31.74 
 
 		 1187 aa  477  1e-133  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  29.86 
 
 		 1259 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  31.71 
 
 		 1187 aa  476  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  31.14 
 
 		 1237 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  33.02 
 
 		 1209 aa  466  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  30.58 
 
 		 1253 aa  466  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  34.05 
 
 		 1194 aa  466  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  33.9 
 
 		 1198 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  33.9 
 
 		 1198 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  34.17 
 
 		 1198 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  31.18 
 
 		 1288 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  34.31 
 
 		 1213 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  33.75 
 
 		 1205 aa  463  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  32.09 
 
 		 1207 aa  462  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  30.34 
 
 		 1253 aa  459  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  30.31 
 
 		 1293 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  30.34 
 
 		 1253 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  32.48 
 
 		 1193 aa  460  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  30.84 
 
 		 1406 aa  458  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  31.87 
 
 		 1206 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  31.28 
 
 		 1242 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  29.55 
 
 		 1256 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.73 
 
 		 1152 aa  453  1.0000000000000001e-126  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  29.59 
 
 		 1253 aa  453  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  29.42 
 
 		 1298 aa  451  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  30.82 
 
 		 1261 aa  453  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  32.53 
 
 		 1190 aa  453  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  31.57 
 
 		 1207 aa  453  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  29.68 
 
 		 1293 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  32.92 
 
 		 1191 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  29.45 
 
 		 1257 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  29.66 
 
 		 1290 aa  449  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  29.57 
 
 		 1222 aa  450  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  31.8 
 
 		 1196 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  29.68 
 
 		 1248 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  29.58 
 
 		 1192 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  29.66 
 
 		 1248 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  29.03 
 
 		 1248 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  30.23 
 
 		 1254 aa  446  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  30.03 
 
 		 1409 aa  446  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  30.02 
 
 		 1203 aa  445  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  29.68 
 
 		 1222 aa  445  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  31.88 
 
 		 1212 aa  445  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1769  cobaltochelatase  42.14 
 
 		 1801 aa  445  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.045286  normal  0.0158644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  38.19 
 
 		 1800 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  29.68 
 
 		 1253 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  32.11 
 
 		 1199 aa  438  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  29.41 
 
 		 1273 aa  438  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  29 
 
 		 1244 aa  435  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  27.9 
 
 		 1302 aa  434  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  29.51 
 
 		 1247 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0118  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.88 
 
 		 1441 aa  435  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  29.76 
 
 		 1270 aa  433  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  30.19 
 
 		 1263 aa  430  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  27.41 
 
 		 1285 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  29.59 
 
 		 1270 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  29.15 
 
 		 1266 aa  430  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  30.02 
 
 		 1247 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  30.15 
 
 		 1254 aa  427  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  28.95 
 
 		 1304 aa  426  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27480  CobN/magnesium chelatase family protein  33.29 
 
 		 1457 aa  425  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.231054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  29.71 
 
 		 1269 aa  422  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  29.06 
 
 		 1240 aa  422  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  29.22 
 
 		 1243 aa  422  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  29.18 
 
 		 1269 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  29.18 
 
 		 1269 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  29.36 
 
 		 1269 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  29.27 
 
 		 1269 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  29.21 
 
 		 1260 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  28.74 
 
 		 1229 aa  416  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  28.91 
 
 		 1280 aa  415  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  28.61 
 
 		 1249 aa  415  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>