241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1315 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  55.81 
 
 		 1193 aa  1368    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  85.11 
 
 		 1248 aa  2203    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  32.53 
 
 		 1268 aa  649    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  62.94 
 
 		 1238 aa  1600    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  33.8 
 
 		 1267 aa  654    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  63.26 
 
 		 1241 aa  1582    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  64.1 
 
 		 1244 aa  1579    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  55.71 
 
 		 1193 aa  1354    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  34.1 
 
 		 1267 aa  660    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  33.41 
 
 		 1275 aa  662    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  62.54 
 
 		 1238 aa  1584    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  33.71 
 
 		 1266 aa  657    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  34.1 
 
 		 1274 aa  683    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  65.13 
 
 		 1242 aa  1659    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  65.95 
 
 		 1249 aa  1679    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  86.23 
 
 		 1248 aa  2204    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  56.72 
 
 		 1173 aa  1377    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  100 
 
 		 1247 aa  2556    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  32.52 
 
 		 1269 aa  649    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  39.94 
 
 		 1245 aa  891    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  87.03 
 
 		 1248 aa  2222    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  33.8 
 
 		 1267 aa  658    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  36.67 
 
 		 1329 aa  855    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  41.83 
 
 		 1261 aa  957    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  32.85 
 
 		 1269 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  56.62 
 
 		 1194 aa  1403    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.06 
 
 		 1217 aa  655    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  63.31 
 
 		 1234 aa  1592    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  40.17 
 
 		 1280 aa  919    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  62.98 
 
 		 1249 aa  1603    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  65.6 
 
 		 1197 aa  1638    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  55.71 
 
 		 1193 aa  1354    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  34.91 
 
 		 1250 aa  651    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2767  magnesium chelatase, H subunit  33.84 
 
 		 1251 aa  634  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1940  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.57 
 
 		 1220 aa  631  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  32.23 
 
 		 1246 aa  622  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  32.23 
 
 		 1246 aa  621  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.58 
 
 		 1248 aa  619  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  32.48 
 
 		 1233 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49527  predicted protein  33.18 
 
 		 1270 aa  606  9.999999999999999e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000228859  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4108  magnesium chelatase, H subunit  32.27 
 
 		 1236 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3620  magnesium chelatase subunit H  31.52 
 
 		 1242 aa  596  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557484  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  30.59 
 
 		 1479 aa  557  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  34.32 
 
 		 1242 aa  554  1e-156  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  40.64 
 
 		 1300 aa  551  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  31.88 
 
 		 1243 aa  547  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  33.07 
 
 		 1187 aa  545  1e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  32.98 
 
 		 1187 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  40.03 
 
 		 1283 aa  538  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  39.33 
 
 		 1277 aa  532  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  36.35 
 
 		 1336 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  37.23 
 
 		 1329 aa  521  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  36.23 
 
 		 1336 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  39.45 
 
 		 1336 aa  519  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  36.65 
 
 		 1335 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  36.35 
 
 		 1336 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  36.92 
 
 		 1328 aa  516  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  35.57 
 
 		 1330 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  36.86 
 
 		 1333 aa  512  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  38.61 
 
 		 1276 aa  510  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  36.99 
 
 		 1328 aa  511  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  34.98 
 
 		 1339 aa  509  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  37.01 
 
 		 1336 aa  504  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  35.29 
 
 		 1343 aa  503  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  37.09 
 
 		 1330 aa  506  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  37.09 
 
 		 1330 aa  506  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  34.94 
 
 		 1337 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  37.97 
 
 		 1296 aa  503  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  32.55 
 
 		 1192 aa  500  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  33.6 
 
 		 1206 aa  501  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  38.3 
 
 		 1277 aa  502  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  36.72 
 
 		 1341 aa  497  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  34.94 
 
 		 1337 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  36.93 
 
 		 1277 aa  491  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  31.41 
 
 		 1266 aa  487  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  32.43 
 
 		 1293 aa  488  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  35.46 
 
 		 1347 aa  489  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  32.67 
 
 		 1207 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  33.49 
 
 		 1207 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  29.48 
 
 		 1244 aa  478  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  30.73 
 
 		 1270 aa  478  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  30.28 
 
 		 1426 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  31.13 
 
 		 1285 aa  475  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  32.94 
 
 		 1203 aa  474  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  30.7 
 
 		 1259 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  28.82 
 
 		 1229 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  29.8 
 
 		 1258 aa  467  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  28.76 
 
 		 1220 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  29.83 
 
 		 1255 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  31.4 
 
 		 1237 aa  467  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  32.49 
 
 		 1193 aa  469  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  32.38 
 
 		 1194 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  32.35 
 
 		 1191 aa  465  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  32.39 
 
 		 1210 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  32.41 
 
 		 1205 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  33.12 
 
 		 1196 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  32.59 
 
 		 1209 aa  459  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.19 
 
 		 1152 aa  456  1.0000000000000001e-126  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  31.59 
 
 		 1222 aa  456  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  31.55 
 
 		 1212 aa  456  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>