241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1732 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  33.14 
 
 		 1268 aa  665    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  33.63 
 
 		 1267 aa  652    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  33.99 
 
 		 1269 aa  669    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1794  magnesium chelatase, H subunit  32.91 
 
 		 1280 aa  673    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  63.28 
 
 		 1244 aa  1565    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  100 
 
 		 1248 aa  2563    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  62.55 
 
 		 1238 aa  1602    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1940  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.12 
 
 		 1220 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  64.67 
 
 		 1197 aa  1634    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  56.47 
 
 		 1193 aa  1380    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  33.18 
 
 		 1267 aa  655    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  32.99 
 
 		 1275 aa  672    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  62.95 
 
 		 1238 aa  1607    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  34.36 
 
 		 1274 aa  684    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  37.75 
 
 		 1330 aa  856    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  65.21 
 
 		 1242 aa  1675    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  38.33 
 
 		 1277 aa  867    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2767  magnesium chelatase, H subunit  34.23 
 
 		 1251 aa  648    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  34.49 
 
 		 1250 aa  664    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  91.91 
 
 		 1248 aa  2368    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  55.94 
 
 		 1173 aa  1374    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  85.11 
 
 		 1247 aa  2223    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  57.18 
 
 		 1194 aa  1434    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  65.92 
 
 		 1249 aa  1704    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  62.23 
 
 		 1241 aa  1575    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  91.59 
 
 		 1248 aa  2362    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  33.7 
 
 		 1233 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  40.14 
 
 		 1283 aa  886    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1436  magnesium chelatase, H subunit  32.62 
 
 		 1273 aa  676    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.958872  normal  0.470699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.77 
 
 		 1248 aa  657    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  33.87 
 
 		 1267 aa  674    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  32.98 
 
 		 1246 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  40.23 
 
 		 1245 aa  895    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.44 
 
 		 1217 aa  678    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.52 
 
 		 1267 aa  669    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  33.89 
 
 		 1273 aa  704    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  37.75 
 
 		 1330 aa  856    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  56.92 
 
 		 1193 aa  1397    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  62.5 
 
 		 1249 aa  1610    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  42.2 
 
 		 1261 aa  964    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  56.47 
 
 		 1193 aa  1379    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  63.59 
 
 		 1234 aa  1608    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  32.98 
 
 		 1246 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  33.06 
 
 		 1269 aa  650    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4108  magnesium chelatase, H subunit  32.8 
 
 		 1236 aa  632  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49527  predicted protein  33.64 
 
 		 1270 aa  625  1e-177  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000228859  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3620  magnesium chelatase subunit H  32.58 
 
 		 1242 aa  626  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557484  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  31.18 
 
 		 1479 aa  572  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  33.7 
 
 		 1242 aa  558  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  40.05 
 
 		 1300 aa  552  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  33.36 
 
 		 1187 aa  549  1e-154  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  33.28 
 
 		 1187 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  38.27 
 
 		 1277 aa  537  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  38.02 
 
 		 1329 aa  535  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  36.27 
 
 		 1336 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  36.27 
 
 		 1336 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  37.15 
 
 		 1328 aa  524  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  36.83 
 
 		 1330 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  36.27 
 
 		 1336 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  36.84 
 
 		 1328 aa  520  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  31.39 
 
 		 1243 aa  523  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  36.4 
 
 		 1333 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  36.47 
 
 		 1329 aa  516  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  38.79 
 
 		 1336 aa  516  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  37.48 
 
 		 1336 aa  514  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  35.64 
 
 		 1335 aa  516  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  35.47 
 
 		 1343 aa  512  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  37.07 
 
 		 1339 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  32.97 
 
 		 1293 aa  509  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  37.11 
 
 		 1341 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  36.68 
 
 		 1337 aa  506  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  36.52 
 
 		 1347 aa  505  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  38.77 
 
 		 1296 aa  502  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  32.17 
 
 		 1192 aa  501  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  35.98 
 
 		 1280 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  36.68 
 
 		 1337 aa  502  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  37.2 
 
 		 1276 aa  496  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  31.65 
 
 		 1285 aa  491  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  30.84 
 
 		 1244 aa  492  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  29.79 
 
 		 1229 aa  489  1e-136  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  36.84 
 
 		 1277 aa  483  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  33.18 
 
 		 1206 aa  486  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  32.01 
 
 		 1210 aa  479  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  32.99 
 
 		 1207 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  30.6 
 
 		 1266 aa  479  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  29.46 
 
 		 1220 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  30.39 
 
 		 1259 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  33.18 
 
 		 1207 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  30.52 
 
 		 1270 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  28.25 
 
 		 1255 aa  463  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  29.6 
 
 		 1263 aa  458  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  31.59 
 
 		 1191 aa  459  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  31.77 
 
 		 1193 aa  455  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  29.54 
 
 		 1258 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  31.6 
 
 		 1409 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  29.27 
 
 		 1298 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  31.54 
 
 		 1209 aa  450  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  30.61 
 
 		 1406 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  31.91 
 
 		 1194 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  32.22 
 
 		 1205 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>