241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2040 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  31.6 
 
 		 1267 aa  650    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  100 
 
 		 1249 aa  2526    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  65.95 
 
 		 1248 aa  1712    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  63.23 
 
 		 1197 aa  1546    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  55.72 
 
 		 1194 aa  1345    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  63 
 
 		 1234 aa  1536    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  40.88 
 
 		 1245 aa  874    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  31.96 
 
 		 1273 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  55.16 
 
 		 1193 aa  1324    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  32.9 
 
 		 1269 aa  649    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  31.6 
 
 		 1267 aa  645    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  32.91 
 
 		 1275 aa  650    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  32.7 
 
 		 1266 aa  663    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  33.31 
 
 		 1274 aa  639    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  62.86 
 
 		 1242 aa  1570    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  61.95 
 
 		 1238 aa  1528    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  31.87 
 
 		 1268 aa  638    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  67.23 
 
 		 1248 aa  1737    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  55.39 
 
 		 1173 aa  1315    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1794  magnesium chelatase, H subunit  32.86 
 
 		 1280 aa  652    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  65.97 
 
 		 1247 aa  1707    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  64.04 
 
 		 1244 aa  1509    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  67.15 
 
 		 1248 aa  1730    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  41.13 
 
 		 1261 aa  904    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  62.09 
 
 		 1241 aa  1499    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  36.08 
 
 		 1329 aa  829    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  38.8 
 
 		 1277 aa  860    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  31.59 
 
 		 1267 aa  640    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  41.54 
 
 		 1283 aa  907    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.25 
 
 		 1217 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.68 
 
 		 1267 aa  650    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  38.56 
 
 		 1280 aa  865    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  41.52 
 
 		 1300 aa  914    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  60.28 
 
 		 1249 aa  1570    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  54.99 
 
 		 1193 aa  1341    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  55.08 
 
 		 1193 aa  1324    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  61.87 
 
 		 1238 aa  1515    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  34.96 
 
 		 1250 aa  624  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2767  magnesium chelatase, H subunit  33.73 
 
 		 1251 aa  616  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1940  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.31 
 
 		 1220 aa  616  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  31.02 
 
 		 1269 aa  619  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  32.54 
 
 		 1246 aa  619  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  32.47 
 
 		 1246 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  33.13 
 
 		 1233 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.07 
 
 		 1248 aa  603  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3620  magnesium chelatase subunit H  31.72 
 
 		 1242 aa  593  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557484  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4108  magnesium chelatase, H subunit  32.09 
 
 		 1236 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49527  predicted protein  31.22 
 
 		 1270 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000228859  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  37.74 
 
 		 1328 aa  530  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  29.42 
 
 		 1479 aa  529  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  34.96 
 
 		 1336 aa  529  1e-148  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  35.32 
 
 		 1336 aa  526  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  34.64 
 
 		 1335 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  34.96 
 
 		 1336 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  39.04 
 
 		 1296 aa  520  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  37.14 
 
 		 1333 aa  516  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  35.96 
 
 		 1328 aa  515  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  36.12 
 
 		 1329 aa  516  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  35.91 
 
 		 1330 aa  512  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  32.35 
 
 		 1242 aa  511  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  30.03 
 
 		 1187 aa  509  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  36.13 
 
 		 1341 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  35.99 
 
 		 1330 aa  509  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  35.99 
 
 		 1330 aa  509  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  36.48 
 
 		 1347 aa  509  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  35.07 
 
 		 1337 aa  505  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  30.91 
 
 		 1243 aa  504  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  37.7 
 
 		 1336 aa  506  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  30.22 
 
 		 1187 aa  506  1e-141  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  35.58 
 
 		 1339 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  34.95 
 
 		 1337 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  38.03 
 
 		 1276 aa  504  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  34.48 
 
 		 1343 aa  499  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  37.13 
 
 		 1336 aa  491  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  37.45 
 
 		 1277 aa  491  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  37.05 
 
 		 1277 aa  483  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  31.47 
 
 		 1192 aa  482  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  30.38 
 
 		 1266 aa  479  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  31.03 
 
 		 1285 aa  474  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  29.59 
 
 		 1244 aa  476  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  32.35 
 
 		 1206 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  30.38 
 
 		 1259 aa  469  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  29.7 
 
 		 1255 aa  466  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  30.59 
 
 		 1258 aa  461  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  32.13 
 
 		 1222 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  32.65 
 
 		 1191 aa  459  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  26.77 
 
 		 1220 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  30.69 
 
 		 1210 aa  451  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  32.54 
 
 		 1207 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  31 
 
 		 1238 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  30.01 
 
 		 1256 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  31.62 
 
 		 1222 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  27.19 
 
 		 1229 aa  446  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  31.61 
 
 		 1209 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.09 
 
 		 1152 aa  446  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  32.31 
 
 		 1203 aa  445  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  32.93 
 
 		 1207 aa  445  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  30.29 
 
 		 1270 aa  446  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  32.25 
 
 		 1199 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  31.15 
 
 		 1205 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>