242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1598 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  56.4 
 
 
1343 aa  1557    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  49.22 
 
 
1229 aa  1244    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  37.02 
 
 
1291 aa  843    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  34.44 
 
 
1238 aa  656    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  33.89 
 
 
1207 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  34.79 
 
 
1222 aa  664    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  62.4 
 
 
1285 aa  1624    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  33.07 
 
 
1255 aa  644    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0292  CobN/magnesium chelatase  47.7 
 
 
1239 aa  1200    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.431661  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  34.46 
 
 
1426 aa  686    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  33.94 
 
 
1298 aa  651    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  34.1 
 
 
1222 aa  660    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  34.92 
 
 
1220 aa  679    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  34.66 
 
 
1193 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  36.17 
 
 
1259 aa  713    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  38.05 
 
 
1237 aa  732    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1022  Cobaltochelatase  36.55 
 
 
1250 aa  706    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.550744  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  37.51 
 
 
1244 aa  801    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  52.95 
 
 
1192 aa  1300    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  33.5 
 
 
1435 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 
1266 aa  2608    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  52.99 
 
 
1270 aa  1405    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  35.67 
 
 
1152 aa  741    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  35.81 
 
 
1256 aa  705    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  51.91 
 
 
1297 aa  1355    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  33.38 
 
 
1302 aa  657    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  34.75 
 
 
1206 aa  642    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  37.26 
 
 
1258 aa  754    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  62.66 
 
 
1293 aa  1615    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  37.24 
 
 
1250 aa  740    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  33.36 
 
 
1266 aa  634  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  33.68 
 
 
1453 aa  631  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  33.33 
 
 
1205 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  33.83 
 
 
1196 aa  624  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  33.52 
 
 
1444 aa  625  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  33.97 
 
 
1199 aa  621  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  33.05 
 
 
1263 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  33.42 
 
 
1191 aa  615  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  33.09 
 
 
1304 aa  615  9.999999999999999e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  33.12 
 
 
1209 aa  610  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  32.86 
 
 
1198 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  32.86 
 
 
1198 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  32.86 
 
 
1198 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  33.39 
 
 
1409 aa  612  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  32.83 
 
 
1288 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  33.69 
 
 
1207 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  32.98 
 
 
1213 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  32.64 
 
 
1212 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  32.93 
 
 
1406 aa  600  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  32.45 
 
 
1194 aa  599  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  32.38 
 
 
1290 aa  596  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  32.63 
 
 
1254 aa  595  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  32.34 
 
 
1254 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  33.28 
 
 
1190 aa  595  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  31.68 
 
 
1253 aa  591  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  31.68 
 
 
1248 aa  593  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  32.42 
 
 
1247 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  31.86 
 
 
1247 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  32.44 
 
 
1203 aa  585  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  32.31 
 
 
1261 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  32.68 
 
 
1330 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  30.58 
 
 
1293 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  32.25 
 
 
1253 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  31.12 
 
 
1244 aa  575  1.0000000000000001e-162  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  33.08 
 
 
1253 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  32.44 
 
 
1270 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  32.79 
 
 
1253 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  32.82 
 
 
1253 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  31.91 
 
 
1257 aa  569  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  32.08 
 
 
1274 aa  568  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  33.13 
 
 
1248 aa  569  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  32.6 
 
 
1328 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  31.95 
 
 
1269 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  32.12 
 
 
1270 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  32.44 
 
 
1248 aa  562  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  31.96 
 
 
1281 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  31.96 
 
 
1281 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  32.55 
 
 
1333 aa  559  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  32.17 
 
 
1267 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  31.88 
 
 
1281 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  31.46 
 
 
1269 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  31.51 
 
 
1273 aa  553  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  35.88 
 
 
1187 aa  555  1e-156  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  32.5 
 
 
1267 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  30.91 
 
 
1275 aa  551  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  32.49 
 
 
1329 aa  552  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  32.37 
 
 
1330 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  31.6 
 
 
1269 aa  553  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  31.6 
 
 
1269 aa  553  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.2 
 
 
1217 aa  551  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  35.41 
 
 
1187 aa  552  1e-155  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  32.09 
 
 
1269 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  32.37 
 
 
1330 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1436  magnesium chelatase, H subunit  31 
 
 
1273 aa  550  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.958872  normal  0.470699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  31.67 
 
 
1278 aa  548  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  32.38 
 
 
1328 aa  544  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  31.13 
 
 
1329 aa  545  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  30.78 
 
 
1268 aa  540  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  30.54 
 
 
1267 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  30.86 
 
 
1273 aa  541  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>