241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2525 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  42.23 
 
 		 1267 aa  1072    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  33.93 
 
 		 1336 aa  694    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  43.64 
 
 		 1268 aa  1098    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  32.7 
 
 		 1277 aa  644    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  32.94 
 
 		 1277 aa  643    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  35.54 
 
 		 1234 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  32.12 
 
 		 1337 aa  676    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  37.3 
 
 		 1245 aa  689    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  37.15 
 
 		 1261 aa  691    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  33.51 
 
 		 1330 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  38.02 
 
 		 1246 aa  890    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1940  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  37.11 
 
 		 1220 aa  825    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  34.16 
 
 		 1328 aa  705    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  43.26 
 
 		 1273 aa  1114    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  38.02 
 
 		 1246 aa  890    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  35.12 
 
 		 1296 aa  652    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  43.09 
 
 		 1267 aa  1085    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  43.9 
 
 		 1275 aa  1125    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  34.09 
 
 		 1336 aa  678    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  33.28 
 
 		 1339 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  43.36 
 
 		 1266 aa  1082    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  46.15 
 
 		 1274 aa  1154    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  36.41 
 
 		 1283 aa  680    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  34.86 
 
 		 1341 aa  701    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4108  magnesium chelatase, H subunit  38.14 
 
 		 1236 aa  903    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  33.72 
 
 		 1336 aa  707    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  34.31 
 
 		 1328 aa  696    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  34.83 
 
 		 1242 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49527  predicted protein  37.62 
 
 		 1270 aa  808    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000228859  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  100 
 
 		 1250 aa  2528    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  34.94 
 
 		 1248 aa  663    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  34.49 
 
 		 1248 aa  662    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  33.33 
 
 		 1333 aa  691    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  34.92 
 
 		 1330 aa  719    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  34.91 
 
 		 1247 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  33.98 
 
 		 1336 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  43.49 
 
 		 1269 aa  1089    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  35.23 
 
 		 1248 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  34.81 
 
 		 1238 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  39.27 
 
 		 1233 aa  882    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  36.16 
 
 		 1479 aa  825    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  37.11 
 
 		 1248 aa  883    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  33.82 
 
 		 1329 aa  710    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  48.98 
 
 		 1269 aa  1175    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  33.51 
 
 		 1330 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  42.5 
 
 		 1267 aa  1075    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  44.27 
 
 		 1217 aa  1078    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  42.49 
 
 		 1267 aa  1075    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  34.79 
 
 		 1280 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1436  magnesium chelatase, H subunit  43.48 
 
 		 1273 aa  1117    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.958872  normal  0.470699 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  34.6 
 
 		 1249 aa  649    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  33.59 
 
 		 1336 aa  704    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  33.44 
 
 		 1335 aa  701    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1794  magnesium chelatase, H subunit  43.21 
 
 		 1280 aa  1107    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  31.92 
 
 		 1337 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  34.25 
 
 		 1347 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  33.9 
 
 		 1343 aa  685    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2767  magnesium chelatase, H subunit  86.45 
 
 		 1251 aa  2159    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  36.28 
 
 		 1300 aa  689    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  35.11 
 
 		 1241 aa  634  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  35.23 
 
 		 1238 aa  632  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  33.18 
 
 		 1276 aa  632  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  34.35 
 
 		 1249 aa  624  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  35.6 
 
 		 1244 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  34.16 
 
 		 1193 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  34.24 
 
 		 1193 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  33.52 
 
 		 1243 aa  544  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  33.01 
 
 		 1193 aa  542  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  30.91 
 
 		 1266 aa  526  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  32.14 
 
 		 1187 aa  522  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  32.14 
 
 		 1187 aa  522  1e-146  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  32.91 
 
 		 1242 aa  516  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  29.95 
 
 		 1259 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3620  magnesium chelatase subunit H  35.11 
 
 		 1242 aa  505  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  32.13 
 
 		 1293 aa  505  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  30.36 
 
 		 1258 aa  494  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  32.65 
 
 		 1285 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  31.03 
 
 		 1192 aa  490  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  32.3 
 
 		 1190 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  33.06 
 
 		 1207 aa  488  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  31.01 
 
 		 1244 aa  487  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  27.19 
 
 		 1229 aa  480  1e-134  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  31.64 
 
 		 1222 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  27.64 
 
 		 1256 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  29.24 
 
 		 1255 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  31.62 
 
 		 1222 aa  469  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  31.75 
 
 		 1206 aa  466  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  30.63 
 
 		 1263 aa  465  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  27.2 
 
 		 1291 aa  463  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  32.14 
 
 		 1191 aa  466  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  32.34 
 
 		 1266 aa  463  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  31.01 
 
 		 1302 aa  461  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  32.68 
 
 		 1193 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  30.46 
 
 		 1297 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  32 
 
 		 1207 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  32.21 
 
 		 1444 aa  458  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  31.51 
 
 		 1205 aa  459  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  32.46 
 
 		 1209 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  30.07 
 
 		 1270 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  30.32 
 
 		 1210 aa  456  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>