241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0287 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  54.49 
 
 		 1241 aa  1286    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  56.22 
 
 		 1248 aa  1374    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  100 
 
 		 1193 aa  2428    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  55.94 
 
 		 1244 aa  1278    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  55.95 
 
 		 1242 aa  1341    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  55.08 
 
 		 1249 aa  1319    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  56.16 
 
 		 1248 aa  1363    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  67.45 
 
 		 1173 aa  1625    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  55.71 
 
 		 1247 aa  1367    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  56.76 
 
 		 1248 aa  1371    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  70.66 
 
 		 1194 aa  1712    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  55.48 
 
 		 1234 aa  1323    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  55.21 
 
 		 1238 aa  1316    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  56.4 
 
 		 1197 aa  1311    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  55.31 
 
 		 1249 aa  1339    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  55.04 
 
 		 1238 aa  1303    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  93.8 
 
 		 1193 aa  2297    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  99.66 
 
 		 1193 aa  2424    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.65 
 
 		 1248 aa  619  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  33.52 
 
 		 1233 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1940  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.1 
 
 		 1220 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  34.06 
 
 		 1250 aa  599  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3620  magnesium chelatase subunit H  32.91 
 
 		 1242 aa  587  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557484  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  32.38 
 
 		 1246 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  32.38 
 
 		 1246 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4108  magnesium chelatase, H subunit  32.4 
 
 		 1236 aa  582  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49527  predicted protein  33.49 
 
 		 1270 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000228859  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  37.96 
 
 		 1328 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  37.85 
 
 		 1333 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  37.53 
 
 		 1330 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  37.86 
 
 		 1329 aa  535  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  39.68 
 
 		 1330 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  39.68 
 
 		 1330 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  39.2 
 
 		 1328 aa  532  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  36.98 
 
 		 1329 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  29.51 
 
 		 1479 aa  523  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  39.42 
 
 		 1336 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  38.82 
 
 		 1339 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  36.26 
 
 		 1343 aa  516  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  37.74 
 
 		 1335 aa  516  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  37.03 
 
 		 1337 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  39.14 
 
 		 1341 aa  511  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  37.38 
 
 		 1336 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  37.01 
 
 		 1336 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  37.29 
 
 		 1337 aa  512  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  39.12 
 
 		 1336 aa  509  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  37.24 
 
 		 1336 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  38.99 
 
 		 1347 aa  509  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  39.4 
 
 		 1296 aa  498  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  39.25 
 
 		 1245 aa  491  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  36.55 
 
 		 1280 aa  489  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  38.41 
 
 		 1261 aa  477  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  38.87 
 
 		 1300 aa  479  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  36.54 
 
 		 1277 aa  478  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  37.19 
 
 		 1276 aa  474  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  31.07 
 
 		 1243 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  30.54 
 
 		 1187 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  37.75 
 
 		 1283 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  36.91 
 
 		 1277 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  36.33 
 
 		 1277 aa  465  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  31.19 
 
 		 1210 aa  458  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  31.17 
 
 		 1192 aa  452  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  29.73 
 
 		 1187 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  28.35 
 
 		 1229 aa  443  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.78 
 
 		 1152 aa  413  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  30.79 
 
 		 1205 aa  405  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  29.65 
 
 		 1193 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  28.73 
 
 		 1812 aa  393  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  28.79 
 
 		 1199 aa  382  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  28.4 
 
 		 1340 aa  383  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  28.61 
 
 		 1366 aa  379  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  29.11 
 
 		 1323 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  29.99 
 
 		 1194 aa  376  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  28.39 
 
 		 1318 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  29.8 
 
 		 1203 aa  365  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  32.3 
 
 		 1273 aa  360  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  31.84 
 
 		 1275 aa  352  2e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1794  magnesium chelatase, H subunit  31.1 
 
 		 1280 aa  352  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  31.62 
 
 		 1266 aa  351  6e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  31.59 
 
 		 1274 aa  350  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  31.56 
 
 		 1268 aa  349  1e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  32.27 
 
 		 1267 aa  346  1e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.9 
 
 		 1217 aa  346  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1436  magnesium chelatase, H subunit  31.05 
 
 		 1273 aa  345  4e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.958872  normal  0.470699 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  31.58 
 
 		 1267 aa  343  9e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  25.64 
 
 		 1758 aa  343  1e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  30.76 
 
 		 1269 aa  343  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1022  Cobaltochelatase  29.12 
 
 		 1250 aa  342  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.550744  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.53 
 
 		 1267 aa  340  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  32.04 
 
 		 1269 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  30.66 
 
 		 1267 aa  338  5e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  29 
 
 		 1250 aa  337  7.999999999999999e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  25.02 
 
 		 2168 aa  334  5e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3507  cobaltochelatase, CobN subunit  29.8 
 
 		 1104 aa  328  6e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11583  normal  0.546877 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  28.13 
 
 		 1579 aa  327  6e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2767  magnesium chelatase, H subunit  41.7 
 
 		 1251 aa  327  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  25.97 
 
 		 1538 aa  325  4e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  25.73 
 
 		 1727 aa  317  8e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3268  cobaltochelatase, CobN subunit  28.73 
 
 		 1115 aa  315  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0228816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1889  cobaltochelatase subunit CobN  30.32 
 
 		 1108 aa  303  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62162  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>