241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1846 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  38.33 
 
 
1330 aa  891    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1794  magnesium chelatase, H subunit  33.62 
 
 
1280 aa  664    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  44.61 
 
 
1283 aa  981    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  64.86 
 
 
1197 aa  1562    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  44.24 
 
 
1300 aa  985    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  33.44 
 
 
1268 aa  639    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  83.51 
 
 
1241 aa  2010    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  38.29 
 
 
1328 aa  879    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  35.36 
 
 
1250 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  55.48 
 
 
1193 aa  1328    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  33.82 
 
 
1275 aa  663    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  76.93 
 
 
1244 aa  1813    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  32.64 
 
 
1266 aa  640    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  100 
 
 
1234 aa  2477    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  32.75 
 
 
1269 aa  648    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  38.12 
 
 
1341 aa  854    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  66.43 
 
 
1242 aa  1662    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  39.69 
 
 
1276 aa  897    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  63.59 
 
 
1248 aa  1619    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  63.58 
 
 
1248 aa  1621    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  56.5 
 
 
1173 aa  1335    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  82.5 
 
 
1238 aa  2040    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  63.31 
 
 
1247 aa  1624    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  45.11 
 
 
1261 aa  981    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  32.71 
 
 
1273 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  55.69 
 
 
1194 aa  1327    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  62.86 
 
 
1248 aa  1602    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  63 
 
 
1249 aa  1538    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  37.82 
 
 
1333 aa  875    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  44.16 
 
 
1245 aa  934    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  82.74 
 
 
1238 aa  2032    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.69 
 
 
1217 aa  647    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  39.71 
 
 
1280 aa  912    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1436  magnesium chelatase, H subunit  32.69 
 
 
1273 aa  642    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.958872  normal  0.470699 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  62.27 
 
 
1249 aa  1572    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  55.75 
 
 
1193 aa  1337    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  55.4 
 
 
1193 aa  1325    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  33.18 
 
 
1246 aa  631  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  33.18 
 
 
1246 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1940  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.71 
 
 
1220 aa  631  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000727492  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  31.66 
 
 
1267 aa  630  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  33.96 
 
 
1233 aa  631  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  32.7 
 
 
1267 aa  629  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2767  magnesium chelatase, H subunit  35.15 
 
 
1251 aa  624  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.79 
 
 
1248 aa  624  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.79 
 
 
1267 aa  625  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  32.53 
 
 
1267 aa  625  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  31.93 
 
 
1269 aa  617  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3620  magnesium chelatase subunit H  31.96 
 
 
1242 aa  606  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557484  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4108  magnesium chelatase, H subunit  33.64 
 
 
1236 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49527  predicted protein  32.86 
 
 
1270 aa  582  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000228859  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  30.57 
 
 
1479 aa  543  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  31.34 
 
 
1242 aa  533  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  40.45 
 
 
1277 aa  526  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  34.76 
 
 
1187 aa  529  1e-148  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  34.73 
 
 
1187 aa  526  1e-147  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  41.42 
 
 
1296 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  37.17 
 
 
1330 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  39.49 
 
 
1277 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  37.17 
 
 
1330 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  30.27 
 
 
1244 aa  514  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  37.52 
 
 
1329 aa  515  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  37.77 
 
 
1328 aa  509  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  35.34 
 
 
1343 aa  501  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  37.56 
 
 
1336 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  37.06 
 
 
1339 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  35.18 
 
 
1329 aa  494  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  38.61 
 
 
1336 aa  493  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  30.85 
 
 
1243 aa  491  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  35.76 
 
 
1337 aa  489  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  35.76 
 
 
1337 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  35.28 
 
 
1336 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  37.86 
 
 
1347 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  38.21 
 
 
1277 aa  481  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  36.3 
 
 
1335 aa  482  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  31.48 
 
 
1259 aa  481  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  35.11 
 
 
1336 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  34.98 
 
 
1336 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  32.16 
 
 
1263 aa  479  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  33.25 
 
 
1293 aa  479  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  32.28 
 
 
1270 aa  476  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  33.74 
 
 
1210 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  32.52 
 
 
1192 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  31.92 
 
 
1266 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  33.65 
 
 
1191 aa  469  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  30.98 
 
 
1258 aa  465  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  28.96 
 
 
1255 aa  466  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  26.52 
 
 
1229 aa  463  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  33.92 
 
 
1207 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  32.08 
 
 
1285 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  29.98 
 
 
1256 aa  462  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  31.69 
 
 
1406 aa  457  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  33.74 
 
 
1206 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  33.15 
 
 
1213 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  33.3 
 
 
1222 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  30.77 
 
 
1426 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  33.43 
 
 
1205 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  34.58 
 
 
1196 aa  452  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  27.51 
 
 
1220 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  29.76 
 
 
1290 aa  447  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>