241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3536 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  55.05 
 
 		 1238 aa  1309    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  70.66 
 
 		 1193 aa  1713    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  54.96 
 
 		 1238 aa  1315    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  54.82 
 
 		 1242 aa  1326    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  56.92 
 
 		 1197 aa  1331    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  56.85 
 
 		 1248 aa  1416    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  55.69 
 
 		 1234 aa  1313    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  69.43 
 
 		 1173 aa  1693    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  56.62 
 
 		 1247 aa  1417    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  56.76 
 
 		 1248 aa  1414    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  57.18 
 
 		 1248 aa  1429    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  100 
 
 		 1194 aa  2442    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  55.72 
 
 		 1249 aa  1338    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  55.47 
 
 		 1241 aa  1294    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  54.41 
 
 		 1249 aa  1327    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  70.17 
 
 		 1193 aa  1714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  70.66 
 
 		 1193 aa  1713    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  55.68 
 
 		 1244 aa  1282    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1940  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.91 
 
 		 1220 aa  634  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.78 
 
 		 1248 aa  632  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  33.94 
 
 		 1233 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  34.66 
 
 		 1250 aa  623  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49527  predicted protein  33.76 
 
 		 1270 aa  610  1e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000228859  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4108  magnesium chelatase, H subunit  32.27 
 
 		 1236 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  32.4 
 
 		 1246 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  32.4 
 
 		 1246 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3620  magnesium chelatase subunit H  32.59 
 
 		 1242 aa  597  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557484  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2767  magnesium chelatase, H subunit  33.52 
 
 		 1251 aa  592  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  39.61 
 
 		 1330 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  30.73 
 
 		 1479 aa  536  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  39.61 
 
 		 1330 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  37.79 
 
 		 1330 aa  536  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  40.44 
 
 		 1329 aa  534  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  38.55 
 
 		 1328 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  39.89 
 
 		 1328 aa  527  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  37.98 
 
 		 1329 aa  526  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  37.4 
 
 		 1343 aa  526  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  37.53 
 
 		 1333 aa  523  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  39.04 
 
 		 1336 aa  516  1e-144  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  39.29 
 
 		 1335 aa  515  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  39.41 
 
 		 1336 aa  511  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  39.94 
 
 		 1336 aa  510  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  39.18 
 
 		 1336 aa  512  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  39.67 
 
 		 1336 aa  512  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  39.46 
 
 		 1300 aa  509  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  30.67 
 
 		 1243 aa  504  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  39.7 
 
 		 1341 aa  505  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  39.25 
 
 		 1339 aa  506  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  38.39 
 
 		 1280 aa  505  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  39.29 
 
 		 1347 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  37.98 
 
 		 1276 aa  496  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  40.33 
 
 		 1261 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  37.2 
 
 		 1277 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  32.23 
 
 		 1210 aa  496  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  39.84 
 
 		 1283 aa  492  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  39.36 
 
 		 1296 aa  492  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  37.53 
 
 		 1337 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  37.53 
 
 		 1337 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  31.34 
 
 		 1187 aa  485  1e-135  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  37.35 
 
 		 1277 aa  480  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  31.16 
 
 		 1187 aa  482  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  36.73 
 
 		 1277 aa  476  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  40.55 
 
 		 1245 aa  473  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  30.99 
 
 		 1192 aa  443  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  28.65 
 
 		 1229 aa  444  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  30.09 
 
 		 1318 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.97 
 
 		 1152 aa  419  9.999999999999999e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  29.63 
 
 		 1340 aa  415  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  29.21 
 
 		 1812 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  29.14 
 
 		 1366 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  27.99 
 
 		 1551 aa  391  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  28.34 
 
 		 1323 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  31.71 
 
 		 1275 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  32.28 
 
 		 1273 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  27.17 
 
 		 1727 aa  367  1e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1794  magnesium chelatase, H subunit  31.59 
 
 		 1280 aa  362  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1436  magnesium chelatase, H subunit  31.97 
 
 		 1273 aa  362  3e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.958872  normal  0.470699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  27.16 
 
 		 1538 aa  361  5e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  25.36 
 
 		 1758 aa  360  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  27.92 
 
 		 1250 aa  360  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  32.09 
 
 		 1274 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  25.68 
 
 		 2168 aa  353  8e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  28.68 
 
 		 1579 aa  350  7e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  31.91 
 
 		 1269 aa  350  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.37 
 
 		 1217 aa  350  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  32.27 
 
 		 1268 aa  348  3e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  25.02 
 
 		 2110 aa  345  2e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  33.15 
 
 		 1267 aa  341  5e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1022  Cobaltochelatase  29.13 
 
 		 1250 aa  340  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.550744  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  30.8 
 
 		 1266 aa  337  5.999999999999999e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  31.26 
 
 		 1267 aa  337  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3268  cobaltochelatase, CobN subunit  30.05 
 
 		 1115 aa  335  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0228816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  32 
 
 		 1269 aa  335  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  31.06 
 
 		 1267 aa  333  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.78 
 
 		 1267 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1889  cobaltochelatase subunit CobN  30.15 
 
 		 1108 aa  320  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3507  cobaltochelatase, CobN subunit  29.69 
 
 		 1104 aa  320  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11583  normal  0.546877 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  25.39 
 
 		 1504 aa  314  7.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0118  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.28 
 
 		 1441 aa  302  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  28.8 
 
 		 1281 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>