241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2583 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  33.49 
 
 		 1267 aa  679    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  32.93 
 
 		 1268 aa  673    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1794  magnesium chelatase, H subunit  33.62 
 
 		 1280 aa  673    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  39.08 
 
 		 1343 aa  899    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  37.46 
 
 		 1337 aa  869    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  39.89 
 
 		 1336 aa  917    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  37.8 
 
 		 1339 aa  884    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  38.43 
 
 		 1328 aa  912    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  38.43 
 
 		 1333 aa  928    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  70.11 
 
 		 1296 aa  1865    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  33.91 
 
 		 1267 aa  667    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  34.03 
 
 		 1275 aa  677    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  37.54 
 
 		 1336 aa  855    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  34.09 
 
 		 1266 aa  663    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  34.12 
 
 		 1274 aa  684    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  32.64 
 
 		 1273 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  37.58 
 
 		 1341 aa  874    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  51.47 
 
 		 1261 aa  1320    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  37.77 
 
 		 1336 aa  885    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  39.23 
 
 		 1328 aa  907    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1436  magnesium chelatase, H subunit  32.77 
 
 		 1273 aa  646    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.958872  normal  0.470699 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  61.49 
 
 		 1277 aa  1665    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  49.96 
 
 		 1245 aa  1251    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  72.67 
 
 		 1277 aa  1933    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  32.12 
 
 		 1267 aa  653    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  38.05 
 
 		 1336 aa  894    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  39.14 
 
 		 1330 aa  939    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  51.55 
 
 		 1300 aa  1356    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  51.7 
 
 		 1283 aa  1355    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  38.21 
 
 		 1330 aa  905    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  39.77 
 
 		 1234 aa  904    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  33.49 
 
 		 1250 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  38.63 
 
 		 1329 aa  914    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  100 
 
 		 1276 aa  2631    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  65.91 
 
 		 1277 aa  1799    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  33.25 
 
 		 1269 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.33 
 
 		 1217 aa  658    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.27 
 
 		 1267 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  74.33 
 
 		 1280 aa  2016    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  35 
 
 		 1269 aa  686    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  37.73 
 
 		 1336 aa  887    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  37.57 
 
 		 1335 aa  890    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  40.35 
 
 		 1238 aa  878    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  37.52 
 
 		 1337 aa  868    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  37.51 
 
 		 1347 aa  853    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  38.5 
 
 		 1329 aa  915    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  38.21 
 
 		 1330 aa  905    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  32.01 
 
 		 1233 aa  599  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  30.7 
 
 		 1479 aa  577  1.0000000000000001e-163  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  31.68 
 
 		 1187 aa  568  1e-160  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  31.68 
 
 		 1187 aa  569  1e-160  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  30.2 
 
 		 1243 aa  537  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  39.97 
 
 		 1249 aa  531  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  38.49 
 
 		 1248 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  31.24 
 
 		 1244 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  38.61 
 
 		 1247 aa  512  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  32.29 
 
 		 1242 aa  513  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  38.32 
 
 		 1249 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  40.78 
 
 		 1197 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  38.57 
 
 		 1248 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  30.02 
 
 		 1220 aa  501  1e-140  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  41.21 
 
 		 1244 aa  502  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  37.83 
 
 		 1248 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  37.68 
 
 		 1194 aa  497  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  30.24 
 
 		 1291 aa  496  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  30.1 
 
 		 1256 aa  493  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  37 
 
 		 1193 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  37.48 
 
 		 1242 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  38.02 
 
 		 1173 aa  488  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  39.02 
 
 		 1238 aa  488  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  37.6 
 
 		 1193 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  31 
 
 		 1288 aa  482  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  37.47 
 
 		 1193 aa  482  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  31.96 
 
 		 1207 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  30.02 
 
 		 1302 aa  477  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  31.53 
 
 		 1237 aa  477  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  31.7 
 
 		 1209 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  30.3 
 
 		 1453 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  28.97 
 
 		 1343 aa  473  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  31.32 
 
 		 1285 aa  473  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  30.59 
 
 		 1263 aa  472  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  30.28 
 
 		 1812 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  30.31 
 
 		 1435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  37.74 
 
 		 1241 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  28.69 
 
 		 1247 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  29.86 
 
 		 1258 aa  468  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  30.5 
 
 		 1293 aa  466  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  29.63 
 
 		 1266 aa  466  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  28.97 
 
 		 1247 aa  466  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  31.88 
 
 		 1199 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  29.92 
 
 		 1298 aa  461  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  30.49 
 
 		 1290 aa  457  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  30.13 
 
 		 1270 aa  458  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  30.05 
 
 		 1297 aa  459  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  30.84 
 
 		 1212 aa  458  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  32.07 
 
 		 1210 aa  456  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  30.61 
 
 		 1238 aa  456  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  30.54 
 
 		 1406 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  30.11 
 
 		 1205 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  30.55 
 
 		 1259 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>