241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1828 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  34.73 
 
 
1268 aa  742    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  70.95 
 
 
1330 aa  1993    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  39.75 
 
 
1300 aa  942    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  72.18 
 
 
1333 aa  2028    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  70.93 
 
 
1330 aa  2009    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2767  magnesium chelatase, H subunit  33.77 
 
 
1251 aa  686    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  84.07 
 
 
1337 aa  2360    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  33.7 
 
 
1267 aa  734    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  70.95 
 
 
1330 aa  1993    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  33.77 
 
 
1269 aa  715    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  81.55 
 
 
1339 aa  2306    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  71.48 
 
 
1328 aa  2024    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  37.3 
 
 
1296 aa  859    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  34.02 
 
 
1267 aa  738    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  35.12 
 
 
1275 aa  738    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  94.16 
 
 
1336 aa  2595    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  33.7 
 
 
1266 aa  730    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  34.64 
 
 
1274 aa  730    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  100 
 
 
1341 aa  2770    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  42.44 
 
 
1261 aa  979    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  79.61 
 
 
1336 aa  2235    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  76.01 
 
 
1328 aa  2103    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  36.85 
 
 
1242 aa  821    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  38.08 
 
 
1277 aa  900    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  37.34 
 
 
1276 aa  864    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  79.99 
 
 
1336 aa  2248    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  70.87 
 
 
1329 aa  1998    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  34.83 
 
 
1269 aa  724    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  39.39 
 
 
1283 aa  942    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1436  magnesium chelatase, H subunit  33.64 
 
 
1273 aa  724    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.958872  normal  0.470699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  34.94 
 
 
1250 aa  700    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  33.9 
 
 
1273 aa  742    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  69.68 
 
 
1329 aa  1989    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  62.2 
 
 
1343 aa  1769    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  37.45 
 
 
1245 aa  879    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  37.84 
 
 
1277 aa  899    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1794  magnesium chelatase, H subunit  34.21 
 
 
1280 aa  723    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.73 
 
 
1217 aa  723    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.1 
 
 
1267 aa  727    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  38.25 
 
 
1280 aa  874    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  65.9 
 
 
1336 aa  1786    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  80.21 
 
 
1336 aa  2253    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  78.71 
 
 
1335 aa  2209    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  83.99 
 
 
1337 aa  2356    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  86.71 
 
 
1347 aa  2411    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  37.68 
 
 
1277 aa  885    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  34.06 
 
 
1267 aa  735    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  32.67 
 
 
1479 aa  628  1e-178  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  32.15 
 
 
1187 aa  599  1e-169  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  35.26 
 
 
1187 aa  587  1e-166  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  32.21 
 
 
1266 aa  546  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  32.39 
 
 
1242 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  30.95 
 
 
1258 aa  534  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  30.93 
 
 
1243 aa  528  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  30.83 
 
 
1259 aa  523  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  31.75 
 
 
1293 aa  520  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  38.04 
 
 
1193 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  31.82 
 
 
1285 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  39.14 
 
 
1193 aa  512  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  30.88 
 
 
1298 aa  510  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  30 
 
 
1244 aa  509  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  29.82 
 
 
1256 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  37.87 
 
 
1193 aa  509  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  38.45 
 
 
1197 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  31.62 
 
 
1210 aa  509  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  37.11 
 
 
1248 aa  506  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  36.13 
 
 
1249 aa  506  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  29.43 
 
 
1302 aa  502  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  39.7 
 
 
1194 aa  502  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  37.66 
 
 
1248 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  37.36 
 
 
1248 aa  503  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  36.59 
 
 
1247 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  30.47 
 
 
1237 aa  497  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  29.38 
 
 
1220 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  38.53 
 
 
1173 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  30.55 
 
 
1297 aa  495  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  40.11 
 
 
1249 aa  496  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  38.14 
 
 
1238 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  29.28 
 
 
1238 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  30.21 
 
 
1453 aa  486  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  30.89 
 
 
1270 aa  484  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  38.27 
 
 
1238 aa  485  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  36.65 
 
 
1234 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  29.79 
 
 
1426 aa  473  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  36.98 
 
 
1241 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0292  CobN/magnesium chelatase  29.48 
 
 
1239 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.431661  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  29.9 
 
 
1409 aa  473  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  27.5 
 
 
1291 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  37.44 
 
 
1244 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  30.15 
 
 
1304 aa  464  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  28.5 
 
 
1206 aa  466  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  29.55 
 
 
1263 aa  466  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  29.43 
 
 
1255 aa  464  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  29.7 
 
 
1406 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  30.33 
 
 
1222 aa  466  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  30.79 
 
 
1207 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  31.03 
 
 
1196 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  29.33 
 
 
1222 aa  459  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  28.88 
 
 
1205 aa  458  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  29.17 
 
 
1198 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>