241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56602 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  34.48 
 
 
1267 aa  828    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  35.13 
 
 
1267 aa  832    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1794  magnesium chelatase, H subunit  34.96 
 
 
1280 aa  810    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  48.45 
 
 
1246 aa  1245    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49527  predicted protein  49.05 
 
 
1270 aa  1241    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000228859  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2767  magnesium chelatase, H subunit  35.43 
 
 
1251 aa  787    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  35.42 
 
 
1273 aa  827    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1940  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  49.75 
 
 
1220 aa  1253    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000727492  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  34.76 
 
 
1268 aa  839    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4108  magnesium chelatase, H subunit  48.38 
 
 
1236 aa  1229    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  34.95 
 
 
1267 aa  823    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  36.1 
 
 
1275 aa  837    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  34.36 
 
 
1266 aa  827    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  35.55 
 
 
1274 aa  832    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  48.41 
 
 
1233 aa  1207    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1436  magnesium chelatase, H subunit  35.03 
 
 
1273 aa  817    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.958872  normal  0.470699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  48.05 
 
 
1248 aa  1232    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  100 
 
 
1479 aa  3025    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  48.38 
 
 
1246 aa  1243    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  34.92 
 
 
1269 aa  832    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.08 
 
 
1267 aa  830    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3620  magnesium chelatase subunit H  48.17 
 
 
1242 aa  1221    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  36.51 
 
 
1269 aa  849    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  36.02 
 
 
1250 aa  810    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  32.67 
 
 
1341 aa  623  1e-177  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  31.7 
 
 
1339 aa  621  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  31.14 
 
 
1336 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  31.89 
 
 
1330 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  31.78 
 
 
1343 aa  609  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  31.4 
 
 
1329 aa  606  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  31.15 
 
 
1336 aa  602  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  30.54 
 
 
1335 aa  602  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  31.15 
 
 
1336 aa  603  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  31.92 
 
 
1283 aa  597  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  30.53 
 
 
1337 aa  599  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  31.98 
 
 
1336 aa  599  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  30.53 
 
 
1337 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  30.25 
 
 
1277 aa  596  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  31.38 
 
 
1261 aa  593  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  30.94 
 
 
1330 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  30.94 
 
 
1330 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  30.87 
 
 
1333 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  31.06 
 
 
1328 aa  579  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  31.29 
 
 
1300 aa  578  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  30.38 
 
 
1277 aa  576  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  30.16 
 
 
1280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  31.08 
 
 
1242 aa  571  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  30.2 
 
 
1277 aa  572  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  39.88 
 
 
1217 aa  572  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  31.18 
 
 
1248 aa  563  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  30.71 
 
 
1248 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  30.74 
 
 
1247 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  30.2 
 
 
1276 aa  560  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  30.43 
 
 
1296 aa  553  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  30.75 
 
 
1248 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  31.02 
 
 
1245 aa  552  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  30.53 
 
 
1238 aa  537  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  31.05 
 
 
1194 aa  534  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  30.14 
 
 
1249 aa  531  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  30.79 
 
 
1238 aa  529  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  30.57 
 
 
1234 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  30.44 
 
 
1241 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  30.46 
 
 
1173 aa  526  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  29.88 
 
 
1193 aa  525  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  29.42 
 
 
1249 aa  521  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  29.59 
 
 
1193 aa  520  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  31.01 
 
 
1244 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  28.9 
 
 
1266 aa  444  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  31.45 
 
 
1187 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  30.33 
 
 
1207 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  28.82 
 
 
1302 aa  437  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  29.24 
 
 
1243 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  31.26 
 
 
1187 aa  438  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  29.8 
 
 
1237 aa  432  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  27.82 
 
 
1244 aa  428  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  28.55 
 
 
1426 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  29.79 
 
 
1270 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  29.83 
 
 
1293 aa  418  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  28.35 
 
 
1285 aa  412  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  28.43 
 
 
1191 aa  412  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  25.67 
 
 
1255 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  27.01 
 
 
1291 aa  404  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  29.51 
 
 
1192 aa  406  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  27.66 
 
 
1256 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  26.1 
 
 
1261 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  27.27 
 
 
1259 aa  398  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  28.5 
 
 
1198 aa  399  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  28.18 
 
 
1198 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  27.53 
 
 
1213 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  28.18 
 
 
1198 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  27.74 
 
 
1406 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  27.09 
 
 
1209 aa  395  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  27.55 
 
 
1199 aa  395  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  27.6 
 
 
1453 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  27.92 
 
 
1229 aa  396  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  25.82 
 
 
1220 aa  392  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  25.68 
 
 
1290 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  27.5 
 
 
1194 aa  393  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  26.27 
 
 
1363 aa  392  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  28.11 
 
 
1304 aa  392  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>