241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2205 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  34.56 
 
 		 1245 aa  682    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  64.2 
 
 		 1273 aa  1753    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  39.44 
 
 		 1246 aa  960    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  32.75 
 
 		 1277 aa  664    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  32.38 
 
 		 1343 aa  683    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  80.96 
 
 		 1267 aa  2192    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  33.83 
 
 		 1337 aa  715    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  35.9 
 
 		 1283 aa  734    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  34.11 
 
 		 1329 aa  726    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1940  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  38.86 
 
 		 1220 aa  932    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  34.39 
 
 		 1328 aa  747    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  33.06 
 
 		 1248 aa  663    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  34.53 
 
 		 1330 aa  744    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4108  magnesium chelatase, H subunit  38.71 
 
 		 1236 aa  944    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  33.86 
 
 		 1296 aa  657    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  79.86 
 
 		 1267 aa  2165    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  63.65 
 
 		 1275 aa  1745    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  33.8 
 
 		 1336 aa  706    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  79.7 
 
 		 1266 aa  2159    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  61.74 
 
 		 1274 aa  1696    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2767  magnesium chelatase, H subunit  43.09 
 
 		 1251 aa  1076    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  34.23 
 
 		 1341 aa  729    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  33.44 
 
 		 1339 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  33.36 
 
 		 1336 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  34.34 
 
 		 1328 aa  716    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  33.55 
 
 		 1242 aa  662    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  34.06 
 
 		 1333 aa  746    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1436  magnesium chelatase, H subunit  64.34 
 
 		 1273 aa  1763    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.958872  normal  0.470699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  32.96 
 
 		 1248 aa  656    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  33.38 
 
 		 1336 aa  718    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  34.85 
 
 		 1479 aa  840    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  33.5 
 
 		 1247 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  33.76 
 
 		 1336 aa  731    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  33.71 
 
 		 1277 aa  693    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  32.93 
 
 		 1248 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  85.86 
 
 		 1268 aa  2291    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  34 
 
 		 1330 aa  741    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1794  magnesium chelatase, H subunit  63.59 
 
 		 1280 aa  1748    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  37.83 
 
 		 1248 aa  937    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  33.72 
 
 		 1329 aa  726    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  34.45 
 
 		 1261 aa  711    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  39.36 
 
 		 1246 aa  958    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  34 
 
 		 1330 aa  741    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  80.33 
 
 		 1267 aa  2181    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  64.64 
 
 		 1217 aa  1671    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  80.96 
 
 		 1267 aa  2190    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  33.7 
 
 		 1280 aa  674    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  38.38 
 
 		 1233 aa  946    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  33.51 
 
 		 1336 aa  715    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  33.05 
 
 		 1335 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  33.23 
 
 		 1276 aa  654    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  48.36 
 
 		 1269 aa  1271    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  33.83 
 
 		 1337 aa  715    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  32.71 
 
 		 1347 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  43.8 
 
 		 1250 aa  1097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  34.75 
 
 		 1300 aa  729    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  35.02 
 
 		 1277 aa  689    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  100 
 
 		 1269 aa  2629    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  31.96 
 
 		 1249 aa  631  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  31.14 
 
 		 1249 aa  617  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  32.1 
 
 		 1234 aa  618  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  31.05 
 
 		 1241 aa  588  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  30.76 
 
 		 1266 aa  553  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  31.51 
 
 		 1285 aa  532  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  30.76 
 
 		 1187 aa  529  1e-148  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  31.84 
 
 		 1293 aa  528  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  31.33 
 
 		 1244 aa  529  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  30.76 
 
 		 1187 aa  528  1e-148  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  31.09 
 
 		 1237 aa  523  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3620  magnesium chelatase subunit H  36.25 
 
 		 1242 aa  524  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  28.84 
 
 		 1343 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  30.04 
 
 		 1426 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  30.15 
 
 		 1222 aa  499  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  29.24 
 
 		 1255 aa  497  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  29.7 
 
 		 1220 aa  496  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  29.85 
 
 		 1222 aa  498  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  30.18 
 
 		 1256 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1291  cobaltochelatase, CobN subunit  30.54 
 
 		 1264 aa  493  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.526885  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  30.39 
 
 		 1259 aa  492  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  30.93 
 
 		 1444 aa  490  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  28.84 
 
 		 1258 aa  490  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  30.02 
 
 		 1243 aa  488  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  28.72 
 
 		 1302 aa  486  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  29.52 
 
 		 1291 aa  483  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  30.04 
 
 		 1207 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49527  predicted protein  34.96 
 
 		 1270 aa  481  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000228859  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  29.9 
 
 		 1238 aa  478  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  28.99 
 
 		 1242 aa  478  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  29.42 
 
 		 1270 aa  479  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  27.95 
 
 		 1192 aa  475  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  28.32 
 
 		 1266 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  29.51 
 
 		 1206 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  29.03 
 
 		 1298 aa  468  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  29.03 
 
 		 1209 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  28.67 
 
 		 1263 aa  466  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  28.97 
 
 		 1247 aa  466  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  28.79 
 
 		 1297 aa  462  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  28.54 
 
 		 1435 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  29.7 
 
 		 1210 aa  458  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  28.58 
 
 		 1453 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>