241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2156 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  40.77 
 
 		 1238 aa  889    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  36.43 
 
 		 1269 aa  674    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  51.43 
 
 		 1300 aa  1347    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  72.67 
 
 		 1276 aa  1906    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  49.29 
 
 		 1245 aa  1249    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  33.02 
 
 		 1268 aa  658    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  37.61 
 
 		 1337 aa  888    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  50.5 
 
 		 1283 aa  1327    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1436  magnesium chelatase, H subunit  33.23 
 
 		 1273 aa  644    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.958872  normal  0.470699 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  37.78 
 
 		 1330 aa  884    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  38.28 
 
 		 1333 aa  904    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  38.37 
 
 		 1343 aa  903    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  38.44 
 
 		 1328 aa  913    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  38.04 
 
 		 1339 aa  892    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  100 
 
 		 1277 aa  2639    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  67.66 
 
 		 1296 aa  1773    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  32.52 
 
 		 1267 aa  652    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  33.62 
 
 		 1275 aa  655    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  37.91 
 
 		 1336 aa  874    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  33.28 
 
 		 1273 aa  661    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  33.04 
 
 		 1266 aa  651    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  33.46 
 
 		 1274 aa  644    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  37.84 
 
 		 1341 aa  894    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  36.79 
 
 		 1336 aa  887    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  38.54 
 
 		 1328 aa  887    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  39.39 
 
 		 1242 aa  883    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  38.57 
 
 		 1329 aa  909    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  33.36 
 
 		 1267 aa  662    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  40.3 
 
 		 1248 aa  917    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  37.09 
 
 		 1336 aa  886    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  39.38 
 
 		 1336 aa  907    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  37.78 
 
 		 1330 aa  884    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1794  magnesium chelatase, H subunit  32.87 
 
 		 1280 aa  649    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  32.7 
 
 		 1250 aa  644    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  37.87 
 
 		 1329 aa  906    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  62.18 
 
 		 1277 aa  1654    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.97 
 
 		 1217 aa  656    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.78 
 
 		 1267 aa  645    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  73.18 
 
 		 1280 aa  1985    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  39.18 
 
 		 1330 aa  932    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  37.23 
 
 		 1336 aa  885    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  36.54 
 
 		 1335 aa  879    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  65.13 
 
 		 1277 aa  1767    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  37.61 
 
 		 1337 aa  885    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  37.65 
 
 		 1347 aa  868    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  32.76 
 
 		 1267 aa  642    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  51.01 
 
 		 1261 aa  1311    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  32.52 
 
 		 1269 aa  649    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  32.42 
 
 		 1246 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  32.42 
 
 		 1246 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  30.11 
 
 		 1479 aa  572  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  30.9 
 
 		 1187 aa  559  1e-157  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  30.73 
 
 		 1187 aa  556  1e-156  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  30.18 
 
 		 1243 aa  552  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  30.05 
 
 		 1242 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  37.39 
 
 		 1249 aa  513  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  32.97 
 
 		 1288 aa  506  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  38.3 
 
 		 1247 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  37.41 
 
 		 1248 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  38.29 
 
 		 1197 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  31.21 
 
 		 1290 aa  495  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  29.96 
 
 		 1244 aa  490  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  31.51 
 
 		 1263 aa  486  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  37.87 
 
 		 1173 aa  487  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  30.81 
 
 		 1237 aa  488  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  39.45 
 
 		 1238 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  37.05 
 
 		 1249 aa  484  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  36.84 
 
 		 1248 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  29.77 
 
 		 1343 aa  481  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  29.98 
 
 		 1285 aa  481  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  36.27 
 
 		 1193 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  30.42 
 
 		 1293 aa  479  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  30.06 
 
 		 1291 aa  479  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  30.24 
 
 		 1297 aa  479  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  29.47 
 
 		 1210 aa  478  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  29.37 
 
 		 1247 aa  476  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  38.21 
 
 		 1234 aa  475  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  36.91 
 
 		 1193 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  36.13 
 
 		 1194 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  28.7 
 
 		 1247 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  30.75 
 
 		 1270 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  29.07 
 
 		 1302 aa  468  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  39.72 
 
 		 1244 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  29.66 
 
 		 1220 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  29.52 
 
 		 1453 aa  469  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  39.14 
 
 		 1241 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  36.91 
 
 		 1193 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  30.76 
 
 		 1406 aa  465  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  30.25 
 
 		 1435 aa  465  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  30.43 
 
 		 1266 aa  465  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  30.47 
 
 		 1205 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  30.29 
 
 		 1194 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  31.09 
 
 		 1207 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  29.97 
 
 		 1444 aa  459  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  29.4 
 
 		 1256 aa  459  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  30.26 
 
 		 1213 aa  458  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  29.43 
 
 		 1261 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  29.92 
 
 		 1199 aa  455  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  29.55 
 
 		 1812 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  31.57 
 
 		 1207 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>