242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3671 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  31.52 
 
 
1727 aa  668    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  45.62 
 
 
1318 aa  1171    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.23 
 
 
1442 aa  662    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  32.92 
 
 
2168 aa  651    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  34.22 
 
 
1538 aa  719    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  31.87 
 
 
1738 aa  675    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  33.97 
 
 
2110 aa  650    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  32.76 
 
 
1758 aa  663    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  74.98 
 
 
1323 aa  2036    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  100 
 
 
1366 aa  2821    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  36.69 
 
 
1812 aa  735    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  66.34 
 
 
1340 aa  1858    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  33.31 
 
 
1551 aa  702    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  33.39 
 
 
1579 aa  635  1e-180  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.62 
 
 
1504 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  33.01 
 
 
1336 aa  594  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  33 
 
 
1300 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  31.4 
 
 
1281 aa  530  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  31.01 
 
 
1281 aa  522  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  29.74 
 
 
1193 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  28.25 
 
 
1206 aa  439  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0118  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.03 
 
 
1441 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  29.58 
 
 
1243 aa  428  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27480  CobN/magnesium chelatase family protein  31.78 
 
 
1457 aa  422  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.231054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  28.35 
 
 
1207 aa  422  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  28.7 
 
 
1191 aa  417  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  27.57 
 
 
1253 aa  420  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  28.24 
 
 
1270 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  28.38 
 
 
1213 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  27.56 
 
 
1229 aa  420  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  29.02 
 
 
1192 aa  416  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  27.62 
 
 
1205 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  28.07 
 
 
1209 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.5 
 
 
1152 aa  412  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  28.51 
 
 
1190 aa  413  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  27.25 
 
 
1194 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  29.79 
 
 
1248 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  28.22 
 
 
1198 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  27.45 
 
 
1256 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  28.22 
 
 
1198 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  28.22 
 
 
1198 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  29.14 
 
 
1194 aa  405  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  28.88 
 
 
1187 aa  404  1e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  28.67 
 
 
1212 aa  401  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  29.13 
 
 
1247 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  29.37 
 
 
1269 aa  399  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  29.23 
 
 
1187 aa  397  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  29.43 
 
 
1245 aa  396  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  30.38 
 
 
1173 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  28.2 
 
 
1199 aa  396  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  29.94 
 
 
1197 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  28.73 
 
 
1242 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  29.43 
 
 
1248 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  28.68 
 
 
1241 aa  389  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  29 
 
 
1248 aa  386  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  28.52 
 
 
1210 aa  385  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  28.28 
 
 
1249 aa  382  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  26.98 
 
 
1203 aa  383  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  28.42 
 
 
1238 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3507  cobaltochelatase, CobN subunit  29.55 
 
 
1104 aa  378  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11583  normal  0.546877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  28.52 
 
 
1193 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  28.06 
 
 
1193 aa  373  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  28.43 
 
 
1193 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  29.88 
 
 
1234 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  27.85 
 
 
1249 aa  365  3e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  28.35 
 
 
1238 aa  364  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  28.43 
 
 
1244 aa  360  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.83 
 
 
2065 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  27.67 
 
 
1242 aa  357  6.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3268  cobaltochelatase, CobN subunit  27.42 
 
 
1115 aa  348  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0228816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0292  CobN/magnesium chelatase  25.83 
 
 
1239 aa  348  6e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.431661  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1940  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.32 
 
 
1220 aa  347  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000727492  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.96 
 
 
1248 aa  345  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  26.64 
 
 
1246 aa  345  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  26.64 
 
 
1246 aa  344  9e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4108  magnesium chelatase, H subunit  26.69 
 
 
1236 aa  343  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1022  Cobaltochelatase  27.09 
 
 
1250 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.550744  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  27.46 
 
 
1175 aa  336  1e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  26.46 
 
 
1250 aa  337  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2767  magnesium chelatase, H subunit  27.38 
 
 
1251 aa  337  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1795  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.17 
 
 
2113 aa  335  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  27.2 
 
 
1233 aa  332  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2260  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.6 
 
 
1750 aa  331  5.0000000000000004e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0356952  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  33.97 
 
 
1800 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  25.47 
 
 
1250 aa  328  5e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1769  cobaltochelatase  32.28 
 
 
1801 aa  327  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.045286  normal  0.0158644 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3620  magnesium chelatase subunit H  25.94 
 
 
1242 aa  320  7.999999999999999e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557484  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2210  cobaltochelatase subunit CobN  27.66 
 
 
1081 aa  317  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2532  cobaltochelatase subunit CobN  27.42 
 
 
1056 aa  314  9e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310665  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49527  predicted protein  26.32 
 
 
1270 aa  311  5.9999999999999995e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000228859  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_002950  PG1553  CobN/magnesium chelatase family protein  34.62 
 
 
1469 aa  308  5.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2931  cobaltochelatase subunit CobN  27.54 
 
 
1090 aa  306  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.347121  hitchhiker  0.00673529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3115  cobaltochelatase subunit CobN  27.83 
 
 
1109 aa  302  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480802  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0753  Cobaltochelatase  30.96 
 
 
1413 aa  300  9e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3144  cobaltochelatase subunit CobN  27.28 
 
 
1140 aa  296  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  31.79 
 
 
1258 aa  294  8e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  29.36 
 
 
1244 aa  293  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  31.44 
 
 
1298 aa  293  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3286  cobaltochelatase subunit CobN  27.64 
 
 
1126 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201105  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  30.78 
 
 
1302 aa  284  8.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>