241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2340 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  33.76 
 
 		 1538 aa  667    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  45.13 
 
 		 1323 aa  1146    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  32.73 
 
 		 1551 aa  666    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  32.54 
 
 		 1812 aa  680    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  45.83 
 
 		 1340 aa  1186    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  100 
 
 		 1318 aa  2735    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  45.66 
 
 		 1366 aa  1174    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.73 
 
 		 1442 aa  624  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  32.47 
 
 		 1579 aa  623  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  31.49 
 
 		 1727 aa  618  1e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  30.98 
 
 		 1758 aa  596  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  30.44 
 
 		 2168 aa  588  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.76 
 
 		 1504 aa  580  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  30.83 
 
 		 2110 aa  582  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  28.47 
 
 		 1738 aa  563  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  32.38 
 
 		 1336 aa  563  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  32.14 
 
 		 1300 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  30.24 
 
 		 1281 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  30.24 
 
 		 1281 aa  530  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  28.06 
 
 		 1220 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  28.79 
 
 		 1229 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  27.94 
 
 		 1266 aa  453  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  30.78 
 
 		 1249 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  30.12 
 
 		 1243 aa  444  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  26.97 
 
 		 1270 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  29.55 
 
 		 1261 aa  440  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  28.62 
 
 		 1330 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  28.17 
 
 		 1245 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  29.31 
 
 		 1192 aa  439  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  30.05 
 
 		 1194 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  27.99 
 
 		 1193 aa  430  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  28.88 
 
 		 1191 aa  429  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  28.9 
 
 		 1256 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  31.34 
 
 		 1187 aa  429  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27480  CobN/magnesium chelatase family protein  32.79 
 
 		 1457 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.231054  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  31.13 
 
 		 1187 aa  424  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  27.25 
 
 		 1206 aa  419  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  29.51 
 
 		 1196 aa  416  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  30.67 
 
 		 1234 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  30.9 
 
 		 1242 aa  412  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0118  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.36 
 
 		 1441 aa  413  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  29.07 
 
 		 1242 aa  411  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.88 
 
 		 1152 aa  409  1.0000000000000001e-112  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  29.42 
 
 		 1247 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  27.54 
 
 		 1194 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  28.17 
 
 		 1213 aa  405  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  27.46 
 
 		 1253 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  28.53 
 
 		 1205 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1940  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.62 
 
 		 1220 aa  396  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  29.17 
 
 		 1241 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  27.34 
 
 		 1293 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  29.35 
 
 		 1248 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.33 
 
 		 1248 aa  392  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  27.83 
 
 		 1233 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  29.04 
 
 		 1248 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  29.01 
 
 		 1238 aa  389  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  28.16 
 
 		 1190 aa  390  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  27.77 
 
 		 1257 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  30.6 
 
 		 1197 aa  386  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  28.99 
 
 		 1248 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  28.05 
 
 		 1203 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  27.89 
 
 		 1207 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  28.44 
 
 		 1173 aa  385  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  27.74 
 
 		 1212 aa  386  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  28.87 
 
 		 1238 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  28.04 
 
 		 1246 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  28.04 
 
 		 1246 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  28.61 
 
 		 1249 aa  382  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  27.76 
 
 		 1198 aa  380  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  27.76 
 
 		 1198 aa  380  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  27.76 
 
 		 1198 aa  380  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  28.44 
 
 		 1210 aa  376  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3620  magnesium chelatase subunit H  29.16 
 
 		 1242 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557484  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4108  magnesium chelatase, H subunit  26.51 
 
 		 1236 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0292  CobN/magnesium chelatase  26.8 
 
 		 1239 aa  372  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.431661  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  27.98 
 
 		 1193 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  28.83 
 
 		 1244 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  28.41 
 
 		 1193 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  28.39 
 
 		 1193 aa  367  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  26.83 
 
 		 1250 aa  367  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  26.88 
 
 		 1281 aa  367  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  26.84 
 
 		 1281 aa  366  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  26.75 
 
 		 1281 aa  365  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3268  cobaltochelatase, CobN subunit  27.48 
 
 		 1115 aa  362  4e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0228816 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  25.88 
 
 		 1267 aa  357  6.999999999999999e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  25.93 
 
 		 1267 aa  357  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  25.28 
 
 		 1268 aa  356  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3507  cobaltochelatase, CobN subunit  28.15 
 
 		 1104 aa  355  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11583  normal  0.546877 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  27.72 
 
 		 1220 aa  347  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  27.72 
 
 		 1220 aa  347  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  27.72 
 
 		 1220 aa  347  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  29.02 
 
 		 1479 aa  347  8.999999999999999e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1022  Cobaltochelatase  26.55 
 
 		 1250 aa  347  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.550744  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  26.59 
 
 		 1269 aa  347  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  27.62 
 
 		 1220 aa  345  5e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  26.59 
 
 		 1175 aa  344  8e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49527  predicted protein  26.63 
 
 		 1270 aa  343  1e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000228859  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  37.01 
 
 		 2065 aa  342  2.9999999999999998e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1795  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.4 
 
 		 2113 aa  327  8.000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1769  cobaltochelatase  31.03 
 
 		 1801 aa  319  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.045286  normal  0.0158644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>