241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3363 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  43.42 
 
 
1336 aa  835    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 
1281 aa  2520    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  96.64 
 
 
1281 aa  2323    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  54.62 
 
 
1300 aa  1339    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  33.33 
 
 
1812 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  31.23 
 
 
1738 aa  573  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  32.26 
 
 
1538 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  32.85 
 
 
1551 aa  563  1e-158  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  30.97 
 
 
1323 aa  556  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  32.26 
 
 
1727 aa  553  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  30.35 
 
 
1318 aa  548  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  31.07 
 
 
1758 aa  535  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  31.01 
 
 
1366 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  30.98 
 
 
1340 aa  532  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  30.89 
 
 
2168 aa  526  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  31.26 
 
 
2110 aa  525  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  31.3 
 
 
1579 aa  491  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.75 
 
 
1442 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.11 
 
 
1504 aa  439  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  32.14 
 
 
1248 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  31.21 
 
 
1273 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  28.32 
 
 
1244 aa  410  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  30.14 
 
 
1406 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2260  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.79 
 
 
1750 aa  405  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0356952  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  30.98 
 
 
1269 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  30.76 
 
 
1267 aa  393  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  30.64 
 
 
1253 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  30.77 
 
 
1253 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  31.13 
 
 
1253 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  32.12 
 
 
1207 aa  389  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  29.58 
 
 
1259 aa  389  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  30.55 
 
 
1267 aa  390  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  31.21 
 
 
1253 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  30.41 
 
 
1409 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  28.57 
 
 
1288 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  30.51 
 
 
1269 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  31.54 
 
 
1270 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  30.52 
 
 
1254 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  30.11 
 
 
1254 aa  383  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  32.55 
 
 
1266 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  28.99 
 
 
1263 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  28.2 
 
 
1280 aa  383  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  28.66 
 
 
1293 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  30.42 
 
 
1257 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  28.44 
 
 
1285 aa  379  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  30.81 
 
 
1261 aa  379  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  28.12 
 
 
1261 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  30.02 
 
 
1269 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  31.03 
 
 
1248 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  30.02 
 
 
1269 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  28.51 
 
 
1276 aa  380  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.38 
 
 
1152 aa  379  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  27.89 
 
 
1435 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  31.33 
 
 
1194 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  30.42 
 
 
1269 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  28.18 
 
 
1247 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  27.96 
 
 
1266 aa  375  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  27.52 
 
 
1336 aa  375  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  32.16 
 
 
1238 aa  373  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  30.71 
 
 
1207 aa  373  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  30.5 
 
 
1190 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  31.16 
 
 
1248 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  27.86 
 
 
1258 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  26.97 
 
 
1333 aa  370  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  30.03 
 
 
1269 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  27.03 
 
 
1336 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  29.52 
 
 
1193 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  28.77 
 
 
1192 aa  370  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  31.12 
 
 
1187 aa  368  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  28.26 
 
 
1247 aa  367  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  32.76 
 
 
1222 aa  367  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  30.75 
 
 
1187 aa  365  4e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  31.58 
 
 
1198 aa  365  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  31.58 
 
 
1198 aa  364  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  28.68 
 
 
1256 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  31.58 
 
 
1198 aa  364  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  28.33 
 
 
1290 aa  364  6e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  30.8 
 
 
1205 aa  363  8e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  30.56 
 
 
1213 aa  363  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  28.37 
 
 
1270 aa  363  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  28.85 
 
 
1253 aa  363  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  26.19 
 
 
1336 aa  362  2e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  30.51 
 
 
1237 aa  362  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  31.15 
 
 
1245 aa  361  6e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  31.18 
 
 
1206 aa  360  8e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  26.91 
 
 
1335 aa  360  9e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  26.19 
 
 
1336 aa  360  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  29.62 
 
 
1199 aa  357  5.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  29.65 
 
 
1247 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  24.89 
 
 
1220 aa  357  5.999999999999999e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  31.1 
 
 
1209 aa  357  6.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  30.56 
 
 
1330 aa  357  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  31.73 
 
 
1240 aa  356  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  26.46 
 
 
1277 aa  357  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  29.47 
 
 
1273 aa  355  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  27.77 
 
 
1336 aa  355  2.9999999999999997e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  30.57 
 
 
1196 aa  355  4e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  28.92 
 
 
1250 aa  355  4e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  31.75 
 
 
1212 aa  354  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  31.39 
 
 
1222 aa  353  8.999999999999999e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>