241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0040 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  37.17 
 
 
1551 aa  897    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.1 
 
 
1442 aa  761    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  51.06 
 
 
1504 aa  1430    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  39.34 
 
 
1538 aa  874    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  36.57 
 
 
1727 aa  894    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  38.49 
 
 
2168 aa  834    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2260  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.43 
 
 
1750 aa  702    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0356952  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  39.49 
 
 
1812 aa  936    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  32.64 
 
 
1340 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  36.57 
 
 
1738 aa  857    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  32.4 
 
 
1366 aa  640    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  38.48 
 
 
1758 aa  854    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  31.25 
 
 
1323 aa  644    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  39.12 
 
 
2110 aa  835    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  100 
 
 
1579 aa  3240    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  32.47 
 
 
1318 aa  622  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  31.29 
 
 
1281 aa  486  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  31.39 
 
 
1281 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  30.82 
 
 
1300 aa  483  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  31.53 
 
 
1336 aa  480  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1795  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  36.03 
 
 
2113 aa  464  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  29.04 
 
 
1270 aa  462  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  29.39 
 
 
1285 aa  457  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  40.75 
 
 
2065 aa  458  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  30.14 
 
 
1259 aa  453  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  29.88 
 
 
1293 aa  452  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  30.54 
 
 
1258 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  30.44 
 
 
1256 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  28.61 
 
 
1192 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  29.23 
 
 
1244 aa  438  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  27.37 
 
 
1220 aa  436  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  27.81 
 
 
1266 aa  436  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  28.16 
 
 
1297 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  29.3 
 
 
1298 aa  429  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  29.74 
 
 
1237 aa  418  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  26.38 
 
 
1291 aa  416  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  28.72 
 
 
1330 aa  413  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  28.8 
 
 
1302 aa  413  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  29.2 
 
 
1222 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  27.15 
 
 
1255 aa  410  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  30.62 
 
 
1187 aa  401  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  30.67 
 
 
1209 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  29.52 
 
 
1266 aa  399  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  29.55 
 
 
1206 aa  399  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0118  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.29 
 
 
1441 aa  398  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  30.55 
 
 
1187 aa  399  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  28.44 
 
 
1406 aa  397  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  42.77 
 
 
1800 aa  396  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1769  cobaltochelatase  39.75 
 
 
1801 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.045286  normal  0.0158644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  27.19 
 
 
1253 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  28.54 
 
 
1300 aa  393  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.23 
 
 
1152 aa  388  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  27.94 
 
 
1435 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  29.4 
 
 
1196 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  27.77 
 
 
1329 aa  389  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  26.67 
 
 
1229 aa  389  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  26.65 
 
 
1335 aa  390  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  28.32 
 
 
1343 aa  385  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  28.14 
 
 
1330 aa  384  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  28.58 
 
 
1304 aa  382  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  27.85 
 
 
1328 aa  383  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  28.58 
 
 
1444 aa  382  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  28.14 
 
 
1330 aa  384  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  29.36 
 
 
1242 aa  381  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  30.71 
 
 
1207 aa  382  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  28.43 
 
 
1207 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1022  Cobaltochelatase  28.18 
 
 
1250 aa  379  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.550744  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  27.92 
 
 
1250 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  26.58 
 
 
1336 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  27.44 
 
 
1248 aa  376  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  28.82 
 
 
1194 aa  376  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  26.61 
 
 
1336 aa  376  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  27.38 
 
 
1409 aa  376  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  29.01 
 
 
1267 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  28.07 
 
 
1283 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  27.77 
 
 
1281 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  27.62 
 
 
1281 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  27.99 
 
 
1257 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  26.41 
 
 
1336 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  28.26 
 
 
1205 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  27.33 
 
 
1277 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  27.44 
 
 
1277 aa  370  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  27.07 
 
 
1337 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  29.75 
 
 
1199 aa  369  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  28.17 
 
 
1278 aa  369  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  27.52 
 
 
1193 aa  369  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  28.83 
 
 
1247 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  28.38 
 
 
1277 aa  369  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  27.07 
 
 
1267 aa  369  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  27.54 
 
 
1281 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  29.3 
 
 
1261 aa  367  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  26.97 
 
 
1253 aa  366  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  27.77 
 
 
1198 aa  366  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  27.77 
 
 
1198 aa  366  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  27.9 
 
 
1270 aa  366  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27480  CobN/magnesium chelatase family protein  29.93 
 
 
1457 aa  365  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.231054  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  27.77 
 
 
1198 aa  365  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  28.5 
 
 
1213 aa  365  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  28.16 
 
 
1254 aa  364  6e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  27.63 
 
 
1269 aa  364  6e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>