241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2685 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  42.3 
 
 		 1300 aa  847    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  100 
 
 		 1336 aa  2666    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  43.62 
 
 		 1281 aa  837    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  43.37 
 
 		 1281 aa  830    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  32.55 
 
 		 1340 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  33.01 
 
 		 1366 aa  599  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  33.3 
 
 		 1812 aa  588  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  33.1 
 
 		 1538 aa  586  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  32.04 
 
 		 1323 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  31.98 
 
 		 1551 aa  567  1e-160  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  32.38 
 
 		 1318 aa  567  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  31.68 
 
 		 1727 aa  558  1e-157  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  30.52 
 
 		 1758 aa  555  1e-156  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  30.84 
 
 		 1738 aa  546  1e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  30.66 
 
 		 2110 aa  538  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  30.58 
 
 		 2168 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  31.7 
 
 		 1579 aa  491  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.28 
 
 		 1442 aa  486  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.81 
 
 		 1504 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  28.56 
 
 		 1244 aa  445  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2260  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.42 
 
 		 1750 aa  432  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0356952  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  29.62 
 
 		 1258 aa  418  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  25.59 
 
 		 1220 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  29.18 
 
 		 1259 aa  396  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  30.88 
 
 		 1237 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  27.58 
 
 		 1280 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  30.38 
 
 		 1206 aa  395  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  27.93 
 
 		 1256 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  26.04 
 
 		 1277 aa  383  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  30.48 
 
 		 1270 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  30.06 
 
 		 1270 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  30.85 
 
 		 1269 aa  379  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  27.86 
 
 		 1290 aa  379  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  29.7 
 
 		 1269 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  30.1 
 
 		 1213 aa  377  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  29.8 
 
 		 1269 aa  376  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  29.8 
 
 		 1269 aa  376  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  27.8 
 
 		 1302 aa  374  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  29.37 
 
 		 1269 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  28.58 
 
 		 1288 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  30.62 
 
 		 1267 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  29.02 
 
 		 1209 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  29.98 
 
 		 1261 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  30.07 
 
 		 1267 aa  369  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  29.67 
 
 		 1263 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  29.67 
 
 		 1263 aa  365  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  26.35 
 
 		 1343 aa  365  4e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  30.88 
 
 		 1203 aa  364  7.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  27.23 
 
 		 1253 aa  363  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  30.41 
 
 		 1273 aa  363  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  28.91 
 
 		 1212 aa  363  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  27.91 
 
 		 1406 aa  362  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  25.68 
 
 		 1328 aa  362  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  27 
 
 		 1298 aa  362  3e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  30.03 
 
 		 1248 aa  361  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  29.09 
 
 		 1254 aa  361  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  25.52 
 
 		 1329 aa  361  5e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  29.44 
 
 		 1248 aa  361  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  30.1 
 
 		 1194 aa  361  6e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  26.27 
 
 		 1277 aa  360  9e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  29.52 
 
 		 1207 aa  360  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  28.87 
 
 		 1193 aa  360  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  26.39 
 
 		 1276 aa  360  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  31.39 
 
 		 1247 aa  359  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  25.74 
 
 		 1330 aa  359  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  25.43 
 
 		 1277 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  29.31 
 
 		 1191 aa  357  5.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  27.71 
 
 		 1304 aa  357  1e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  30.81 
 
 		 1207 aa  357  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  28.77 
 
 		 1254 aa  356  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  29.58 
 
 		 1198 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  27.39 
 
 		 1435 aa  355  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  29.58 
 
 		 1198 aa  355  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  29.58 
 
 		 1198 aa  355  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  30.03 
 
 		 1205 aa  355  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  29.37 
 
 		 1253 aa  355  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  27.86 
 
 		 1293 aa  354  5.9999999999999994e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  25.73 
 
 		 1333 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  25.84 
 
 		 1255 aa  353  2e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  28.85 
 
 		 1199 aa  352  4e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  27.54 
 
 		 1296 aa  351  6e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  29.68 
 
 		 1253 aa  350  8e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  27.3 
 
 		 1261 aa  349  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  29.25 
 
 		 1278 aa  349  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  30.96 
 
 		 1196 aa  347  7e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  27.63 
 
 		 1363 aa  347  8.999999999999999e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  29.65 
 
 		 1240 aa  347  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  29.91 
 
 		 1190 aa  346  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  26.33 
 
 		 1341 aa  346  2e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  28.47 
 
 		 1247 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  29.72 
 
 		 1234 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  29.58 
 
 		 1263 aa  343  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  31.08 
 
 		 1300 aa  343  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  24.22 
 
 		 1244 aa  342  2.9999999999999998e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  28.43 
 
 		 1187 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  28.22 
 
 		 1285 aa  341  5e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  30.69 
 
 		 1249 aa  340  8e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  28.67 
 
 		 1247 aa  340  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  24.47 
 
 		 1330 aa  340  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  24.47 
 
 		 1330 aa  340  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>