241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_39640 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  96.64 
 
 
1281 aa  2333    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  43.66 
 
 
1336 aa  840    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 
1281 aa  2519    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  55.79 
 
 
1300 aa  1355    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  33.87 
 
 
1812 aa  609  9.999999999999999e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  29.84 
 
 
1738 aa  576  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  32.21 
 
 
1551 aa  572  1e-161  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  31.4 
 
 
1323 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  32.26 
 
 
1538 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  32.41 
 
 
1727 aa  558  1e-157  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  31.4 
 
 
1366 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  30.29 
 
 
1318 aa  545  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  31.26 
 
 
1340 aa  543  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  30.39 
 
 
1758 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  30.49 
 
 
2168 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  30.81 
 
 
2110 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  31.27 
 
 
1579 aa  496  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.95 
 
 
1442 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.4 
 
 
1504 aa  450  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  31.47 
 
 
1273 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2260  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.72 
 
 
1750 aa  410  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0356952  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  28.42 
 
 
1244 aa  412  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  29.97 
 
 
1406 aa  406  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  32.23 
 
 
1248 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  31.65 
 
 
1270 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  31.53 
 
 
1281 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  30.31 
 
 
1269 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  29.05 
 
 
1259 aa  392  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  31.36 
 
 
1281 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  30.43 
 
 
1267 aa  390  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  31.47 
 
 
1270 aa  389  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  31.53 
 
 
1281 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  30.62 
 
 
1409 aa  386  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  30.65 
 
 
1253 aa  386  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  32.44 
 
 
1194 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  28.55 
 
 
1285 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.11 
 
 
1152 aa  380  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  30.8 
 
 
1269 aa  383  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  30.43 
 
 
1267 aa  383  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  31.77 
 
 
1207 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  28.83 
 
 
1293 aa  383  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  30.3 
 
 
1253 aa  383  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  30.3 
 
 
1254 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  28.77 
 
 
1288 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  32.29 
 
 
1266 aa  380  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  29.1 
 
 
1263 aa  379  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  31.59 
 
 
1278 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  30.88 
 
 
1269 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  28.24 
 
 
1247 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  28.26 
 
 
1280 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  28.25 
 
 
1276 aa  379  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  30.18 
 
 
1257 aa  377  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  31.31 
 
 
1198 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  31.09 
 
 
1248 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  31.26 
 
 
1187 aa  375  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  31.31 
 
 
1198 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  27.89 
 
 
1435 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  31.31 
 
 
1198 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  31.05 
 
 
1187 aa  371  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  28.09 
 
 
1247 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  31.03 
 
 
1207 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  30.02 
 
 
1261 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  28.27 
 
 
1261 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  30.94 
 
 
1213 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  28.23 
 
 
1258 aa  370  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  27.85 
 
 
1266 aa  372  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  28.32 
 
 
1256 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  31.44 
 
 
1205 aa  372  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  27.29 
 
 
1328 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  29.85 
 
 
1193 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  31.44 
 
 
1330 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  31.18 
 
 
1237 aa  369  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  28.43 
 
 
1192 aa  370  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  32.1 
 
 
1220 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  27.23 
 
 
1333 aa  367  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  31.9 
 
 
1209 aa  366  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  25.16 
 
 
1220 aa  367  1e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  32 
 
 
1220 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  30.19 
 
 
1254 aa  366  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  32 
 
 
1220 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  32 
 
 
1220 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  32.93 
 
 
1222 aa  365  4e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  30.18 
 
 
1206 aa  364  6e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  28.58 
 
 
1270 aa  363  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  28.78 
 
 
1290 aa  362  3e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  25.98 
 
 
1336 aa  361  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  27.03 
 
 
1330 aa  361  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  27.9 
 
 
1255 aa  359  9.999999999999999e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  29.75 
 
 
1273 aa  360  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  31.27 
 
 
1196 aa  359  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  30.25 
 
 
1190 aa  359  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  29.7 
 
 
1199 aa  358  2.9999999999999997e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  27.42 
 
 
1328 aa  357  5.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  25.75 
 
 
1336 aa  356  1e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  27.32 
 
 
1329 aa  356  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  31.79 
 
 
1212 aa  356  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  31.28 
 
 
1238 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  30.88 
 
 
1234 aa  355  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  29.05 
 
 
1263 aa  355  4e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  30.78 
 
 
1222 aa  354  8e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>