241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2652 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  42.3 
 
 		 1336 aa  851    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  54.47 
 
 		 1281 aa  1325    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 		 1300 aa  2625    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  56.22 
 
 		 1281 aa  1343    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  33.27 
 
 		 1538 aa  582  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  33.97 
 
 		 1812 aa  583  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  32.67 
 
 		 1551 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  32.6 
 
 		 1323 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  31.6 
 
 		 1318 aa  560  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  31.82 
 
 		 1366 aa  558  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  33.15 
 
 		 1340 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  32.53 
 
 		 1727 aa  547  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  30.16 
 
 		 2168 aa  536  1e-151  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  31.51 
 
 		 1758 aa  538  1e-151  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  31.09 
 
 		 2110 aa  534  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  31.34 
 
 		 1738 aa  529  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.65 
 
 		 1442 aa  492  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  30.82 
 
 		 1579 aa  490  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.57 
 
 		 1504 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2260  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.19 
 
 		 1750 aa  434  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0356952  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  30.65 
 
 		 1269 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  28.83 
 
 		 1244 aa  404  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  31.05 
 
 		 1270 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  31.23 
 
 		 1273 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  30.96 
 
 		 1270 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  31.1 
 
 		 1269 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  30.8 
 
 		 1281 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  29.34 
 
 		 1259 aa  395  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  30.8 
 
 		 1281 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  30.62 
 
 		 1281 aa  397  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  30.02 
 
 		 1253 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  29.66 
 
 		 1406 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  30.87 
 
 		 1269 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  30.87 
 
 		 1269 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  30.52 
 
 		 1267 aa  392  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  27.82 
 
 		 1293 aa  390  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  30.14 
 
 		 1253 aa  386  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  29.22 
 
 		 1266 aa  384  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  29.58 
 
 		 1248 aa  383  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  30.17 
 
 		 1206 aa  383  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  29.33 
 
 		 1192 aa  380  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  28.5 
 
 		 1258 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  28.68 
 
 		 1435 aa  379  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  25.81 
 
 		 1220 aa  380  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  31.72 
 
 		 1220 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  28.72 
 
 		 1257 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  31.72 
 
 		 1220 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  29.7 
 
 		 1191 aa  375  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  30.13 
 
 		 1213 aa  376  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  31.23 
 
 		 1187 aa  374  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  28.69 
 
 		 1273 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  31.72 
 
 		 1220 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  28.82 
 
 		 1263 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  28.36 
 
 		 1254 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  29.21 
 
 		 1209 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  31.25 
 
 		 1330 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  27.35 
 
 		 1328 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  27.25 
 
 		 1330 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  29.69 
 
 		 1263 aa  373  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  29.64 
 
 		 1285 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  30.35 
 
 		 1194 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  29.89 
 
 		 1409 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  31.14 
 
 		 1187 aa  373  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  30.04 
 
 		 1205 aa  372  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  31.62 
 
 		 1220 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  29.17 
 
 		 1263 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  29.17 
 
 		 1263 aa  370  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  29.63 
 
 		 1266 aa  370  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  30.29 
 
 		 1207 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  30.36 
 
 		 1261 aa  370  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  29.93 
 
 		 1237 aa  370  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  27.64 
 
 		 1261 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  28.24 
 
 		 1293 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  27.63 
 
 		 1333 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  26.46 
 
 		 1229 aa  364  6e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  29.12 
 
 		 1193 aa  363  9e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  29.4 
 
 		 1207 aa  362  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.34 
 
 		 1152 aa  360  8e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  27.44 
 
 		 1247 aa  360  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  28.81 
 
 		 1254 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  30.52 
 
 		 1238 aa  358  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  28.35 
 
 		 1250 aa  358  5e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  27.13 
 
 		 1329 aa  357  5.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  27.77 
 
 		 1253 aa  357  7.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27480  CobN/magnesium chelatase family protein  29.54 
 
 		 1457 aa  356  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.231054  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  29.92 
 
 		 1240 aa  356  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  28.47 
 
 		 1270 aa  355  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  25.77 
 
 		 1244 aa  355  5e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  27.78 
 
 		 1290 aa  354  5.9999999999999994e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  26.63 
 
 		 1255 aa  354  5.9999999999999994e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  27.54 
 
 		 1330 aa  353  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  30.58 
 
 		 1212 aa  353  8.999999999999999e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  27.54 
 
 		 1330 aa  353  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  27.31 
 
 		 1247 aa  352  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  30.13 
 
 		 1190 aa  352  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  28.98 
 
 		 1247 aa  350  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  28.89 
 
 		 1249 aa  351  7e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  30.18 
 
 		 1203 aa  350  8e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  31.16 
 
 		 1247 aa  350  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  25.99 
 
 		 1253 aa  350  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>