241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0792 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0792  Cobaltochelatase  100 
 
 		 1515 aa  3003    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27480  CobN/magnesium chelatase family protein  48.07 
 
 		 1457 aa  653    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.231054  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0118  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  51.62 
 
 		 1441 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  33.13 
 
 		 1538 aa  398  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  32.13 
 
 		 1551 aa  391  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  30.53 
 
 		 1727 aa  359  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2260  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.52 
 
 		 1750 aa  310  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0356952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  29.85 
 
 		 1288 aa  309  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  31.96 
 
 		 1237 aa  303  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  24.03 
 
 		 1220 aa  300  2e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  28.5 
 
 		 1255 aa  296  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  30.96 
 
 		 1247 aa  291  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  32.34 
 
 		 1318 aa  290  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  29.02 
 
 		 1277 aa  287  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  31.92 
 
 		 1248 aa  287  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  28.63 
 
 		 1290 aa  286  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  29.41 
 
 		 1336 aa  284  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  30.8 
 
 		 1300 aa  281  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  29.03 
 
 		 1323 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  30.09 
 
 		 1366 aa  276  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  31.34 
 
 		 1340 aa  276  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  30.91 
 
 		 1240 aa  275  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  29.19 
 
 		 1222 aa  273  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  29.31 
 
 		 1266 aa  269  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  31.12 
 
 		 1579 aa  270  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  23.84 
 
 		 1291 aa  268  5e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  28.05 
 
 		 1242 aa  266  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.12 
 
 		 1504 aa  263  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1291  cobaltochelatase, CobN subunit  28.34 
 
 		 1264 aa  262  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.526885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  28.95 
 
 		 1293 aa  260  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  28.33 
 
 		 1812 aa  260  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  29.57 
 
 		 1206 aa  250  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.8 
 
 		 2065 aa  250  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.76 
 
 		 1152 aa  247  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  28.24 
 
 		 1198 aa  243  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  28.23 
 
 		 1198 aa  243  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  28.23 
 
 		 1198 aa  243  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  25.98 
 
 		 1245 aa  243  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  26.77 
 
 		 1270 aa  241  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  32.09 
 
 		 1738 aa  241  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0921  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  25.68 
 
 		 1245 aa  237  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.308916  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  32.52 
 
 		 1800 aa  230  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  27.77 
 
 		 2168 aa  229  4e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1769  cobaltochelatase  32.32 
 
 		 1801 aa  228  7e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.045286  normal  0.0158644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1795  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.21 
 
 		 2113 aa  228  9e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  29.77 
 
 		 1758 aa  227  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  30.83 
 
 		 2110 aa  226  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.07 
 
 		 1442 aa  225  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1553  CobN/magnesium chelatase family protein  29.96 
 
 		 1469 aa  219  4e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  34.56 
 
 		 1281 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0753  Cobaltochelatase  27.63 
 
 		 1413 aa  213  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  34.34 
 
 		 1281 aa  213  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  33.55 
 
 		 1300 aa  206  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  33.55 
 
 		 1283 aa  205  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  32.63 
 
 		 1244 aa  205  5e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  31.09 
 
 		 1277 aa  202  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.36 
 
 		 1248 aa  201  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  26.93 
 
 		 1233 aa  201  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  30.41 
 
 		 1256 aa  198  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  33.19 
 
 		 1260 aa  198  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  29.94 
 
 		 1253 aa  197  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  34.66 
 
 		 1453 aa  196  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  31.68 
 
 		 1293 aa  196  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  29.87 
 
 		 1280 aa  192  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  34.66 
 
 		 1409 aa  192  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  31.94 
 
 		 1263 aa  191  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  31.94 
 
 		 1263 aa  191  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2371  cobaltochelatase subunit CobN  33.65 
 
 		 1388 aa  190  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408289  normal  0.0205166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  32.51 
 
 		 1406 aa  189  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  33.8 
 
 		 1249 aa  189  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  33.61 
 
 		 1286 aa  189  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  32.01 
 
 		 1261 aa  189  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  30.56 
 
 		 1330 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  30.56 
 
 		 1330 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  30.34 
 
 		 1333 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  34.4 
 
 		 1302 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  31.73 
 
 		 1263 aa  187  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  33.26 
 
 		 1273 aa  187  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  33.04 
 
 		 1269 aa  186  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  29.21 
 
 		 1244 aa  186  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  34.12 
 
 		 1253 aa  186  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  33.05 
 
 		 1253 aa  185  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  30.47 
 
 		 1330 aa  185  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  33.19 
 
 		 1281 aa  185  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  30.06 
 
 		 1329 aa  185  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  33.19 
 
 		 1220 aa  185  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  33.19 
 
 		 1220 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  33.05 
 
 		 1253 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  32.22 
 
 		 1257 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  32.59 
 
 		 1269 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  31.91 
 
 		 1245 aa  184  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  32.82 
 
 		 1267 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  33.19 
 
 		 1220 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  33.19 
 
 		 1220 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  33.19 
 
 		 1281 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  31.52 
 
 		 1267 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  29.74 
 
 		 1277 aa  184  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  33.12 
 
 		 1248 aa  184  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  33.19 
 
 		 1281 aa  184  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2900  cobaltochelatase, CobN subunit  31.6 
 
 		 1348 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241164  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>