241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0738 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  45.59 
 
 		 1253 aa  1033    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  39.71 
 
 		 1222 aa  765    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  50.69 
 
 		 1263 aa  1210    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  44.64 
 
 		 1254 aa  1025    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  45.11 
 
 		 1220 aa  945    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  44.83 
 
 		 1254 aa  1039    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.41 
 
 		 1262 aa  758    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  39.89 
 
 		 1453 aa  823    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  50.54 
 
 		 1273 aa  1202    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  42.48 
 
 		 1288 aa  1018    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  45.02 
 
 		 1267 aa  1045    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  47.85 
 
 		 1281 aa  1063    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  45.52 
 
 		 1257 aa  1047    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  47.44 
 
 		 1269 aa  1068    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  47.32 
 
 		 1269 aa  1066    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  50.31 
 
 		 1263 aa  1207    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1121  cobaltochelatase, CobN subunit  39.42 
 
 		 1256 aa  795    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  45.74 
 
 		 1253 aa  1034    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  78.73 
 
 		 1249 aa  1960    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1357  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  39.51 
 
 		 1242 aa  815    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.250832 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  38.98 
 
 		 1253 aa  931    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0921  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.23 
 
 		 1245 aa  780    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.308916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  41.65 
 
 		 1247 aa  988    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  45.69 
 
 		 1263 aa  1029    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  46.27 
 
 		 1253 aa  1050    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  46.76 
 
 		 1248 aa  1050    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  51.93 
 
 		 1240 aa  1194    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  47.62 
 
 		 1278 aa  1071    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  39.77 
 
 		 1364 aa  693    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 		 1286 aa  2553    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  32.14 
 
 		 1255 aa  661    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  37.3 
 
 		 1435 aa  818    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  42.37 
 
 		 1261 aa  989    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  37.23 
 
 		 1426 aa  809    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  42.41 
 
 		 1293 aa  968    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  40.56 
 
 		 1238 aa  796    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  44.98 
 
 		 1267 aa  1050    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  45.11 
 
 		 1220 aa  945    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  85.85 
 
 		 1247 aa  2089    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  40.96 
 
 		 1222 aa  776    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  53.73 
 
 		 1330 aa  1086    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  47.36 
 
 		 1269 aa  1066    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  39.53 
 
 		 1237 aa  804    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  32.92 
 
 		 1245 aa  777    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  39.11 
 
 		 1406 aa  793    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  47.43 
 
 		 1270 aa  1067    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  46.36 
 
 		 1248 aa  1029    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  47.39 
 
 		 1269 aa  1050    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  47.36 
 
 		 1269 aa  1066    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  34.26 
 
 		 1244 aa  704    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  35.03 
 
 		 1253 aa  789    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  45.9 
 
 		 1253 aa  1043    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  47.36 
 
 		 1270 aa  1065    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  44.52 
 
 		 1269 aa  1021    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  49.31 
 
 		 1235 aa  1137    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  49.88 
 
 		 1260 aa  1186    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  45.03 
 
 		 1220 aa  943    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  50.77 
 
 		 1263 aa  1214    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09821  cobalamin biosynthetic protein CobN  32.85 
 
 		 1245 aa  771    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  42.93 
 
 		 1290 aa  1025    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  33.97 
 
 		 1245 aa  798    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  33.13 
 
 		 1262 aa  755    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2371  cobaltochelatase subunit CobN  51.4 
 
 		 1388 aa  1061    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408289  normal  0.0205166 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  38.46 
 
 		 1259 aa  795    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  45.11 
 
 		 1220 aa  945    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  41.72 
 
 		 1247 aa  995    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  40.02 
 
 		 1409 aa  787    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  47.62 
 
 		 1281 aa  1061    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  47.54 
 
 		 1281 aa  1060    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  32.51 
 
 		 1258 aa  630  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  32.69 
 
 		 1259 aa  612  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  34.07 
 
 		 1302 aa  607  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  33.07 
 
 		 1298 aa  583  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  42.89 
 
 		 1273 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  42.44 
 
 		 1248 aa  572  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  27.56 
 
 		 1244 aa  551  1e-155  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  33.18 
 
 		 1304 aa  542  9.999999999999999e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  33.44 
 
 		 1293 aa  531  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  33.1 
 
 		 1285 aa  529  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  44.31 
 
 		 1363 aa  526  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2900  cobaltochelatase, CobN subunit  44.07 
 
 		 1348 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  29.63 
 
 		 1343 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  28.12 
 
 		 1291 aa  484  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3268  cobaltochelatase, CobN subunit  41.99 
 
 		 1115 aa  478  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0228816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  30.31 
 
 		 1297 aa  479  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1889  cobaltochelatase subunit CobN  41.45 
 
 		 1108 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3507  cobaltochelatase, CobN subunit  40.4 
 
 		 1104 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11583  normal  0.546877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  32.46 
 
 		 1261 aa  461  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  30.21 
 
 		 1280 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1436  cobaltochelatase subunit CobN  42.15 
 
 		 1144 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11738  normal  0.80922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1714  cobaltochelatase subunit CobN  41.4 
 
 		 1143 aa  446  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185329  decreased coverage  0.00608846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3286  cobaltochelatase subunit CobN  41.96 
 
 		 1126 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201105  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  29.13 
 
 		 1277 aa  443  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1439  cobaltochelatase subunit CobN  41.26 
 
 		 1143 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.293615  normal  0.816429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3115  cobaltochelatase subunit CobN  43.32 
 
 		 1109 aa  436  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  29.42 
 
 		 1277 aa  436  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  29.46 
 
 		 1330 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  28.14 
 
 		 1328 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0342  cobaltochelatase subunit CobN  39.25 
 
 		 1094 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2210  cobaltochelatase subunit CobN  38.22 
 
 		 1081 aa  425  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>