241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1553 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1553  CobN/magnesium chelatase family protein  100 
 
 		 1469 aa  3042    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0753  Cobaltochelatase  39.16 
 
 		 1413 aa  1141    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  36.63 
 
 		 1812 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  37.5 
 
 		 1340 aa  335  5e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  37.53 
 
 		 1579 aa  328  3e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  36.64 
 
 		 1538 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  35.6 
 
 		 1323 aa  314  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  34.62 
 
 		 1366 aa  308  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  33.16 
 
 		 1758 aa  301  8e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.2 
 
 		 1442 aa  300  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  34.34 
 
 		 1318 aa  300  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  33.66 
 
 		 1738 aa  298  5e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  33.4 
 
 		 1551 aa  298  6e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.36 
 
 		 1504 aa  298  7e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  32.43 
 
 		 2168 aa  295  4e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1795  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.61 
 
 		 2113 aa  295  5e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.4 
 
 		 2065 aa  294  8e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  34.25 
 
 		 2110 aa  290  1e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1769  cobaltochelatase  34.24 
 
 		 1801 aa  289  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.045286  normal  0.0158644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  33.97 
 
 		 1800 aa  282  4e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  32.38 
 
 		 1336 aa  264  8.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  34.27 
 
 		 1300 aa  260  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  30.82 
 
 		 1727 aa  259  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  33.57 
 
 		 1281 aa  254  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  33.57 
 
 		 1281 aa  253  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2260  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.9 
 
 		 1750 aa  247  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0356952  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  32.55 
 
 		 1277 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  32.79 
 
 		 1280 aa  244  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  33.18 
 
 		 1277 aa  244  9e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  32.32 
 
 		 1283 aa  244  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  29.37 
 
 		 1300 aa  243  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  31.93 
 
 		 1277 aa  236  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27480  CobN/magnesium chelatase family protein  30.07 
 
 		 1457 aa  233  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.231054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  32.48 
 
 		 1276 aa  234  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  31.56 
 
 		 1273 aa  233  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  30.48 
 
 		 1261 aa  233  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  31.38 
 
 		 1245 aa  228  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  33.26 
 
 		 1261 aa  226  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  33.02 
 
 		 1266 aa  226  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  33.11 
 
 		 1260 aa  226  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  33.1 
 
 		 1242 aa  224  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  30.14 
 
 		 1333 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  29.51 
 
 		 1330 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0118  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.96 
 
 		 1441 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2371  cobaltochelatase subunit CobN  32.48 
 
 		 1388 aa  222  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408289  normal  0.0205166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  30.62 
 
 		 1247 aa  222  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  30.61 
 
 		 1330 aa  221  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  30.61 
 
 		 1330 aa  221  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  30.95 
 
 		 1244 aa  221  8.999999999999998e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  33.49 
 
 		 1263 aa  220  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  33.49 
 
 		 1263 aa  221  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  30.56 
 
 		 1329 aa  219  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  30.77 
 
 		 1270 aa  219  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  30.98 
 
 		 1297 aa  219  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  30.41 
 
 		 1293 aa  219  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0792  Cobaltochelatase  29.96 
 
 		 1515 aa  219  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  29.87 
 
 		 1247 aa  218  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  30.65 
 
 		 1267 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  31.45 
 
 		 1267 aa  216  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.4 
 
 		 1267 aa  216  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  29.27 
 
 		 1328 aa  216  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  30.18 
 
 		 1290 aa  214  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  32.64 
 
 		 1263 aa  214  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  31.51 
 
 		 1247 aa  213  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  32.31 
 
 		 1187 aa  213  3e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  33.49 
 
 		 1241 aa  212  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  31.84 
 
 		 1187 aa  212  5e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  30.34 
 
 		 1363 aa  211  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  31.29 
 
 		 1285 aa  211  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  29.75 
 
 		 1293 aa  211  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  29.6 
 
 		 1267 aa  209  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  32.71 
 
 		 1197 aa  209  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  29.72 
 
 		 1343 aa  209  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  30.14 
 
 		 1245 aa  208  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  29.75 
 
 		 1269 aa  208  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  30.98 
 
 		 1409 aa  207  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  31.99 
 
 		 1238 aa  207  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  30.86 
 
 		 1192 aa  207  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  31.06 
 
 		 1220 aa  207  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  30.82 
 
 		 1281 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.38 
 
 		 1152 aa  206  3e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  30.82 
 
 		 1220 aa  206  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  30.82 
 
 		 1220 aa  206  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  30.82 
 
 		 1220 aa  206  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  30.82 
 
 		 1281 aa  206  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  30.84 
 
 		 1296 aa  206  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  30.82 
 
 		 1281 aa  205  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  30.07 
 
 		 1266 aa  205  5e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  30.59 
 
 		 1278 aa  205  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  32.53 
 
 		 1330 aa  204  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  30.07 
 
 		 1267 aa  204  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  29.03 
 
 		 1288 aa  204  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  28.03 
 
 		 1229 aa  204  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  30.43 
 
 		 1207 aa  204  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  30.88 
 
 		 1270 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  31.25 
 
 		 1193 aa  203  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  24.25 
 
 		 1274 aa  203  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  30.79 
 
 		 1267 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  31.75 
 
 		 1238 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  30.56 
 
 		 1269 aa  202  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>