243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2532 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2827  cobaltochelatase subunit CobN  68.28 
 
 		 1078 aa  1286    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3507  cobaltochelatase, CobN subunit  43.64 
 
 		 1104 aa  802    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11583  normal  0.546877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3144  cobaltochelatase subunit CobN  43.93 
 
 		 1140 aa  738    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0342  cobaltochelatase subunit CobN  62.37 
 
 		 1094 aa  1160    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3268  cobaltochelatase, CobN subunit  43.83 
 
 		 1115 aa  795    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0228816 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2931  cobaltochelatase subunit CobN  60.88 
 
 		 1090 aa  1199    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.347121  hitchhiker  0.00673529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1889  cobaltochelatase subunit CobN  56.23 
 
 		 1108 aa  1051    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2210  cobaltochelatase subunit CobN  67.07 
 
 		 1081 aa  1317    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3286  cobaltochelatase subunit CobN  45.07 
 
 		 1126 aa  696    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201105  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3115  cobaltochelatase subunit CobN  42.19 
 
 		 1109 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1518  cobaltochelatase subunit CobN  68.37 
 
 		 1078 aa  1297    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0624953  normal  0.136834 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2532  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 		 1056 aa  2081    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1468  cobaltochelatase subunit CobN  68.28 
 
 		 1078 aa  1284    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1436  cobaltochelatase subunit CobN  40.92 
 
 		 1144 aa  631  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11738  normal  0.80922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2438  cobaltochelatase subunit CobN  44.63 
 
 		 1099 aa  629  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.621018  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2149  cobaltochelatase subunit CobN  43.44 
 
 		 1103 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304993  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1439  cobaltochelatase subunit CobN  41.22 
 
 		 1143 aa  625  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.293615  normal  0.816429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1714  cobaltochelatase subunit CobN  40.82 
 
 		 1143 aa  616  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185329  decreased coverage  0.00608846 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  37.11 
 
 		 1263 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  37.91 
 
 		 1260 aa  395  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  39.01 
 
 		 1249 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  38.46 
 
 		 1240 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  37.2 
 
 		 1263 aa  385  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  37.06 
 
 		 1263 aa  382  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  36.36 
 
 		 1273 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  34.27 
 
 		 1288 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  38.29 
 
 		 1247 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  37.61 
 
 		 1267 aa  376  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  37.83 
 
 		 1286 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  36.97 
 
 		 1269 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  36.62 
 
 		 1263 aa  366  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  37.27 
 
 		 1267 aa  363  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  36.55 
 
 		 1269 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  36.55 
 
 		 1269 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  36.91 
 
 		 1273 aa  359  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  36.12 
 
 		 1235 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  35.9 
 
 		 1247 aa  358  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  32.91 
 
 		 1290 aa  356  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  36.46 
 
 		 1269 aa  355  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  35.69 
 
 		 1247 aa  354  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  25.88 
 
 		 1152 aa  354  4e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  36.78 
 
 		 1269 aa  354  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  37.27 
 
 		 1281 aa  354  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  37.27 
 
 		 1281 aa  353  7e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  37.27 
 
 		 1281 aa  353  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  33.05 
 
 		 1261 aa  353  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  36.33 
 
 		 1270 aa  350  9e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  36.52 
 
 		 1248 aa  348  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  36.05 
 
 		 1269 aa  348  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  36.19 
 
 		 1270 aa  347  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  36.27 
 
 		 1248 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  35.93 
 
 		 1253 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  35.93 
 
 		 1253 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  45.45 
 
 		 1330 aa  340  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  35.7 
 
 		 1253 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  35.62 
 
 		 1253 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  36.1 
 
 		 1248 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  37.21 
 
 		 1278 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  33.84 
 
 		 1254 aa  337  9e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  34.58 
 
 		 1254 aa  336  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  27.74 
 
 		 1323 aa  336  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2371  cobaltochelatase subunit CobN  44.5 
 
 		 1388 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408289  normal  0.0205166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  34.07 
 
 		 1257 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  28.54 
 
 		 1192 aa  325  4e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  27.42 
 
 		 1366 aa  323  9.000000000000001e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2900  cobaltochelatase, CobN subunit  35.09 
 
 		 1348 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  32.72 
 
 		 1293 aa  317  9e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  44.1 
 
 		 1220 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  44.1 
 
 		 1220 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  27.74 
 
 		 1340 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  44.1 
 
 		 1220 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  43.86 
 
 		 1220 aa  313  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  25.72 
 
 		 1318 aa  299  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  31.01 
 
 		 1363 aa  297  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  37.07 
 
 		 1253 aa  295  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  33.38 
 
 		 1406 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  42.19 
 
 		 1175 aa  281  4e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  41.41 
 
 		 1222 aa  278  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  32.71 
 
 		 1453 aa  278  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  40.94 
 
 		 1222 aa  278  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  28 
 
 		 1173 aa  278  5e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  32.71 
 
 		 1259 aa  278  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1121  cobaltochelatase, CobN subunit  38.13 
 
 		 1256 aa  276  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  39.9 
 
 		 1196 aa  275  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  34.89 
 
 		 1262 aa  274  6e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.89 
 
 		 1262 aa  273  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  33.49 
 
 		 1253 aa  272  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  27.51 
 
 		 1194 aa  271  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  32.66 
 
 		 1205 aa  271  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  39.55 
 
 		 1238 aa  269  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1291  cobaltochelatase, CobN subunit  40.15 
 
 		 1264 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.526885  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  27.36 
 
 		 1247 aa  269  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  39.8 
 
 		 1198 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  39.8 
 
 		 1198 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  32.29 
 
 		 1237 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  39.8 
 
 		 1198 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  39.31 
 
 		 1191 aa  267  8e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  29.47 
 
 		 1435 aa  266  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  32.91 
 
 		 1409 aa  266  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  39.52 
 
 		 1206 aa  266  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>