38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3242 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  100 
 
 		 163 aa  331  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  79.33 
 
 		 150 aa  251  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  52.35 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  34.9 
 
 		 185 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  32.88 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  29.61 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  35.66 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  31.85 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  29.58 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  27.61 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  26.67 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2204  rubrerythrin  30.19 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00985009  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  26.21 
 
 		 161 aa  50.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  28.19 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  27.52 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0913  hypothetical protein  27.4 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  42 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0804  Rubrerythrin  24.68 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0179  rubrerythrin  29.41 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0146382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1880  Rubrerythrin  25.17 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1735  rubrerythrin  27.86 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00859619  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0797  rubrerythrin  25.53 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_784  rubrerythrin-like protein  27.89 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  26.53 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0888  rubrerythrin  31.08 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.581272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0384  hypothetical protein  26.17 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0086  rubrerythrin  23.78 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  29.66 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  26.57 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  26.21 
 
 		 161 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2340  Rubrerythrin  23.78 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000319292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  26.03 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3145  rubrerythrin  26.17 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  31.03 
 
 		 323 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  28.8 
 
 		 165 aa  40.8  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  29.19 
 
 		 327 aa  40.8  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  25 
 
 		 165 aa  40.8  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  26.24 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>