38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0416 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  100 
 
 		 185 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  37.16 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  35.17 
 
 		 150 aa  93.2  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  34.9 
 
 		 163 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  33.09 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  34.07 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  30.22 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  32.09 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  30.6 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0797  rubrerythrin  27.46 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0913  hypothetical protein  26.21 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2204  rubrerythrin  31.51 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00985009  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  28.36 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  26.87 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_784  rubrerythrin-like protein  26.76 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0384  hypothetical protein  24.83 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  30 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  29.61 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  29.17 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  29.17 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  40.35 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3145  rubrerythrin  24.34 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  26.76 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  26.76 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  26.76 
 
 		 139 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  31.88 
 
 		 323 aa  45.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0179  rubrerythrin  22.82 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0146382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  28.37 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  30.28 
 
 		 161 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0804  Rubrerythrin  24.03 
 
 		 157 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  27.46 
 
 		 165 aa  44.7  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  31.33 
 
 		 327 aa  44.7  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  32.47 
 
 		 327 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  32.47 
 
 		 327 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  28.87 
 
 		 154 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  26.76 
 
 		 165 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  31.82 
 
 		 327 aa  42  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0250  hypothetical protein  25.64 
 
 		 168 aa  42  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>