31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1323 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  100 
 
 		 149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  57.62 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  54.97 
 
 		 151 aa  183  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  45.7 
 
 		 151 aa  156  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  49.67 
 
 		 150 aa  156  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  50.99 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  39.74 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  34.35 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  28.36 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  27.61 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_002936  DET0913  hypothetical protein  29.14 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  24.82 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  26.99 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  28.38 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_784  rubrerythrin-like protein  30.2 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  28.48 
 
 		 277 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  27.52 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1085  hypothetical protein  30.72 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265267 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  21.13 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  29.79 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  36.07 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  39.34 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  28.06 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2186  hypothetical protein  33.96 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0086  rubrerythrin  26.25 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1735  rubrerythrin  26.52 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00859619  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  39.34 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  39.34 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0874  Rubrerythrin  25.87 
 
 		 165 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000319278  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0797  rubrerythrin  27.45 
 
 		 173 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2204  rubrerythrin  27.08 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00985009  normal  0.20081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>