31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3150 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  50.33 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  49.67 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  49.67 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  49.67 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  45.7 
 
 		 151 aa  151  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  43.71 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  33.09 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  29.58 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2204  rubrerythrin  31.43 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00985009  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  27.92 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0913  hypothetical protein  28.48 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  31.43 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0086  rubrerythrin  26.85 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2304  Rubrerythrin  28.38 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000648386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  26.97 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0384  hypothetical protein  27.66 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  24.82 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  26.56 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2957  Rubrerythrin  24.67 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_784  rubrerythrin-like protein  28.57 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  26.32 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  35.59 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  24.34 
 
 		 284 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  27.14 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2291  rubrerythrin  26.8 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.683509  normal  0.317377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3626  Rubrerythrin  27.03 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2193  hypothetical protein  26.85 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3560  Rubrerythrin  27.03 
 
 		 158 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  40.38 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>