31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0765 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  100 
 
 		 151 aa  310  2.9999999999999996e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2114  Rubrerythrin  62.25 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  57.62 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  54.97 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3150  rubrerythrin  50.33 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  49.67 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  42.38 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  29.61 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  29.85 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0913  hypothetical protein  29.94 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  26.87 
 
 		 185 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0797  rubrerythrin  29.41 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1052  Rubrerythrin  23.53 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.376741  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_784  rubrerythrin-like protein  29.41 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  29.68 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  30.41 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  28.38 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0034  rubrerythrin  30.95 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.475045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2291  rubrerythrin  28.29 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.683509  normal  0.317377 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  24.83 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  28.79 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  29.58 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  38.46 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  38.46 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  28.87 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  23.57 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  38.46 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1735  rubrerythrin  28.03 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00859619  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  25.52 
 
 		 284 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  23.94 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2723  rubrerythrin  40 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0811811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>