35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1315 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  347  6e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0430  rubrerythrin  46.3 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  44.44 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  40.51 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2967  hypothetical protein  38.27 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2193  hypothetical protein  40.12 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  40.65 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2291  rubrerythrin  40.49 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.683509  normal  0.317377 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2111  hypothetical protein  31.4 
 
 		 169 aa  84  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  34.52 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  33.93 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2304  Rubrerythrin  27.5 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000648386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1897  hypothetical protein  25 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00778692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1509  hypothetical protein  29.33 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2707  hypothetical protein  28.19 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000186708 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  29.37 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  29.61 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  23.29 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  26.99 
 
 		 149 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  23.57 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  26.21 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  27.94 
 
 		 282 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2134  YhjR  25.2 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  28.86 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  27.12 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1735  rubrerythrin  27.81 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00859619  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1807  rubrerythrin  29.63 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  29.05 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  26.57 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3103  YhjR  24.41 
 
 		 144 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  27.13 
 
 		 1005 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4365  Peptidoglycan-binding LysM  28.99 
 
 		 229 aa  41.6  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3134  hypothetical protein  23.62 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  26.76 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  27.7 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>