23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0477 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  100 
 
 
164 aa  329  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0086  rubrerythrin  31.76 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0888  rubrerythrin  30.32 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.581272  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1735  rubrerythrin  32.24 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00859619  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1223  hypothetical protein  31.79 
 
 
167 aa  57.8  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.389238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  29.37 
 
 
171 aa  57.4  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  27.7 
 
 
154 aa  47.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  28.67 
 
 
161 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1928  rubrerythrin  23.42 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521013  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  28.76 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  27.08 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2440  Rubrerythrin  23.46 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0250  hypothetical protein  28.57 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336504  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  25.16 
 
 
363 aa  44.3  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2744  hypothetical protein  27.95 
 
 
207 aa  44.3  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.601156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  24.34 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1642  hypothetical protein  21.85 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  24.52 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2340  Rubrerythrin  22.64 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000319292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1880  Rubrerythrin  22.64 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0745  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  32.86 
 
 
994 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  25.33 
 
 
165 aa  40.8  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  36.21 
 
 
994 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>