16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2744 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2744  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  423  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.601156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1928  rubrerythrin  53.46 
 
 		 165 aa  167  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1642  hypothetical protein  52.47 
 
 		 164 aa  165  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2340  Rubrerythrin  48.73 
 
 		 162 aa  148  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000319292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1880  Rubrerythrin  48.1 
 
 		 162 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1058  rubrerythrin  47.8 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2440  Rubrerythrin  41.51 
 
 		 163 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  37.5 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  38.12 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  36.88 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  36.88 
 
 		 165 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  35.62 
 
 		 165 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  35 
 
 		 165 aa  98.6  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  30.77 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  27.95 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  22.82 
 
 		 277 aa  42  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>