18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1928 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1928  rubrerythrin  100 
 
 		 165 aa  340  5e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1642  hypothetical protein  73.46 
 
 		 164 aa  253  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2440  Rubrerythrin  62.11 
 
 		 163 aa  215  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1880  Rubrerythrin  61.25 
 
 		 162 aa  207  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2340  Rubrerythrin  59.38 
 
 		 162 aa  202  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000319292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1058  rubrerythrin  55.28 
 
 		 163 aa  187  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2744  hypothetical protein  53.46 
 
 		 207 aa  167  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.601156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  43.64 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  43.03 
 
 		 165 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  41.82 
 
 		 165 aa  134  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  43.03 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  43.03 
 
 		 165 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  41.82 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0250  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  23.42 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  25.33 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  31.51 
 
 		 159 aa  41.2  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.76 
 
 		 359 aa  40.4  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>