16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0250 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0250  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  341  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  32.89 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1642  hypothetical protein  26.81 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  28.19 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  28.19 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1735  rubrerythrin  27.66 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00859619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1928  rubrerythrin  28.57 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  26.35 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2440  Rubrerythrin  28.08 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  28.57 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0888  rubrerythrin  25.19 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.581272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  29.05 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  26 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  26.76 
 
 		 165 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  25.64 
 
 		 185 aa  42  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2744  hypothetical protein  28.17 
 
 		 207 aa  41.2  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.601156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>