20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1735 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1735  rubrerythrin  100 
 
 		 161 aa  322  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00859619  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1223  hypothetical protein  51.2 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.389238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0888  rubrerythrin  42.5 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.581272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0086  rubrerythrin  40.85 
 
 		 168 aa  91.7  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  32.24 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  29.5 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0250  hypothetical protein  27.66 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  31.82 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  27.39 
 
 		 277 aa  47.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  27.86 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  27.14 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  27.81 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  51.16 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1323  rubrerythrin  26.52 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  45.45 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  28.03 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.17 
 
 		 323 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  35.09 
 
 		 1008 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  35.09 
 
 		 1011 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  46.51 
 
 		 165 aa  40.4  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>