19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1642 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1642  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  339  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1928  rubrerythrin  73.46 
 
 		 165 aa  253  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2440  Rubrerythrin  62.73 
 
 		 163 aa  206  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1880  Rubrerythrin  58.75 
 
 		 162 aa  194  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2340  Rubrerythrin  59.38 
 
 		 162 aa  195  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000319292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1058  rubrerythrin  58.39 
 
 		 163 aa  187  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2744  hypothetical protein  52.47 
 
 		 207 aa  165  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.601156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  44.03 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  42.77 
 
 		 165 aa  124  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  42.14 
 
 		 165 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  42.14 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  40.88 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  38.99 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0250  hypothetical protein  26.81 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  24.65 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  25.18 
 
 		 363 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  21.85 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  39.66 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  24 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>