45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1655 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  70.65 
 
 
359 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  58.06 
 
 
373 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  55.56 
 
 
352 aa  99  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  54.44 
 
 
358 aa  97.4  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  48.91 
 
 
119 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  48.45 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  60.29 
 
 
99 aa  84.3  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4294  hypothetical protein  46.67 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00503085  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2029  hypothetical protein  52.38 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1164  hypothetical protein  50.62 
 
 
102 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527792  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0817  hypothetical protein  56.52 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  51.28 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1211  hypothetical protein  55.07 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000304169  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  45.35 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  45.16 
 
 
346 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  48.15 
 
 
104 aa  77  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2360  hypothetical protein  51.28 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  48.94 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0627  hypothetical protein  48.81 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  48.72 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1061  hypothetical protein  45.98 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0482  hypothetical protein  49.38 
 
 
102 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0449183 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0270  hypothetical protein  48.1 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  43.18 
 
 
123 aa  72  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1800  hypothetical protein  47.44 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  49.25 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0856  hypothetical protein  49.32 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.354631  hitchhiker  0.0042327 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  45 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0098  hypothetical protein  50.67 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0221803  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_108  hypothetical protein  49.33 
 
 
102 aa  70.1  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  49.28 
 
 
101 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1094  hypothetical protein  45.98 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1064  hypothetical protein  56.45 
 
 
77 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2998  hypothetical protein  50.75 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0884  Rubrerythrin  60.34 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00115612  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1284  hypothetical protein  45 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0184871  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  45 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2114  hypothetical protein  48.28 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00651332  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1533  hypothetical protein  44.62 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000142155  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1065  hypothetical protein  35.71 
 
 
89 aa  47  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0347  hypothetical protein  34.52 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2440  Rubrerythrin  37.93 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1642  hypothetical protein  39.66 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  37.93 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>