21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2440 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2440  Rubrerythrin  100 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1928  rubrerythrin  62.11 
 
 		 165 aa  215  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1642  hypothetical protein  62.73 
 
 		 164 aa  206  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2340  Rubrerythrin  56.88 
 
 		 162 aa  191  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000319292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1880  Rubrerythrin  55.62 
 
 		 162 aa  189  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1058  rubrerythrin  57.06 
 
 		 163 aa  181  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2744  hypothetical protein  41.51 
 
 		 207 aa  134  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.601156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  39.62 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  41.51 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  40.88 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  38.99 
 
 		 165 aa  124  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  36.48 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  35.22 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0250  hypothetical protein  28.08 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  23.46 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1300  hypothetical protein  25.69 
 
 		 189 aa  44.3  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000609616 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  35.71 
 
 		 352 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  35.71 
 
 		 358 aa  42.4  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  39.62 
 
 		 346 aa  42  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  37.93 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  28.78 
 
 		 185 aa  40.8  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>