33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3289 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  83.64 
 
 		 165 aa  294  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  73.94 
 
 		 165 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  68.48 
 
 		 165 aa  236  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  65.45 
 
 		 165 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  64.85 
 
 		 165 aa  224  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1928  rubrerythrin  41.82 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1642  hypothetical protein  40.88 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2744  hypothetical protein  38.12 
 
 		 207 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.601156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2440  Rubrerythrin  36.48 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2340  Rubrerythrin  38.99 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000319292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1880  Rubrerythrin  38.99 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1058  rubrerythrin  35.85 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  32.14 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  28.08 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  28.87 
 
 		 363 aa  50.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2925  hypothetical protein  26.9 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  28.47 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  26.14 
 
 		 170 aa  47.4  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0179  rubrerythrin  23.49 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0146382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1300  hypothetical protein  26.21 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000609616 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  27.59 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2254  rubrerythrin  26.43 
 
 		 226 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.26968e-16  hitchhiker  0.0000000000000112808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3145  rubrerythrin  24.16 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  27.46 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0250  hypothetical protein  26 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  27.56 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  40.35 
 
 		 359 aa  42  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  29.22 
 
 		 154 aa  42  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  29.17 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  40.35 
 
 		 352 aa  41.2  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  40.74 
 
 		 358 aa  41.2  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  28.8 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>