37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4415 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  100 
 
 		 165 aa  340  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  73.94 
 
 		 165 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  71.52 
 
 		 165 aa  256  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  70.3 
 
 		 165 aa  244  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  69.7 
 
 		 165 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  66.06 
 
 		 165 aa  227  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1928  rubrerythrin  43.03 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2440  Rubrerythrin  38.99 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1642  hypothetical protein  42.14 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2340  Rubrerythrin  40.88 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000319292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1880  Rubrerythrin  40.25 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2744  hypothetical protein  36.88 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.601156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1058  rubrerythrin  37.74 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2925  hypothetical protein  28.97 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1300  hypothetical protein  27.59 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000609616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  30.46 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  26.62 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0250  hypothetical protein  26.35 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  26.53 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0384  hypothetical protein  26.17 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  27.46 
 
 		 363 aa  44.3  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  29.31 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  25.17 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  42.59 
 
 		 358 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  41.82 
 
 		 359 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  42.59 
 
 		 352 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3145  rubrerythrin  24.16 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1735  rubrerythrin  45.45 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00859619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  37.25 
 
 		 154 aa  42  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0179  rubrerythrin  22.38 
 
 		 158 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0146382  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  38.89 
 
 		 373 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  27.54 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  26.17 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  40.38 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  24.83 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  25 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  27.42 
 
 		 150 aa  40.4  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>