8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2925 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2925  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1300  hypothetical protein  91.98 
 
 		 189 aa  361  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000609616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  28.47 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  28.28 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  28.97 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  28.67 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  26.9 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  25.52 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>