9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1300 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1300  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000609616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2925  hypothetical protein  91.98 
 
 		 189 aa  361  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  28.47 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  28.47 
 
 		 165 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  28.67 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  27.59 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  24.83 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  26.21 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2440  Rubrerythrin  25.69 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>