29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3238 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  100 
 
 		 165 aa  341  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  83.64 
 
 		 165 aa  294  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  71.52 
 
 		 165 aa  256  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  64.85 
 
 		 165 aa  225  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  63.03 
 
 		 165 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  62.42 
 
 		 165 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1928  rubrerythrin  43.03 
 
 		 165 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2440  Rubrerythrin  35.22 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1642  hypothetical protein  38.99 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2744  hypothetical protein  36.88 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.601156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2340  Rubrerythrin  35.85 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000319292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1880  Rubrerythrin  35.22 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1058  rubrerythrin  35.85 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  33.79 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2925  hypothetical protein  25.52 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  27.21 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2254  rubrerythrin  28.57 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.26968e-16  hitchhiker  0.0000000000000112808 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  25.49 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  31.03 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  28.86 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1300  hypothetical protein  24.83 
 
 		 189 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000609616 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  27.78 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  27.46 
 
 		 363 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0179  rubrerythrin  23.49 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0146382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3145  rubrerythrin  24.83 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  30.51 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  29.66 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  26.76 
 
 		 185 aa  42  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0250  hypothetical protein  26.76 
 
 		 168 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>