21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1880 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1880  Rubrerythrin  100 
 
 		 162 aa  333  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2340  Rubrerythrin  95.68 
 
 		 162 aa  326  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000319292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1928  rubrerythrin  61.25 
 
 		 165 aa  207  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1642  hypothetical protein  58.75 
 
 		 164 aa  194  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2440  Rubrerythrin  55.62 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1058  rubrerythrin  48.75 
 
 		 163 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2744  hypothetical protein  48.1 
 
 		 207 aa  147  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.601156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  40.25 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  39.24 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  38.61 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  40.25 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  38.99 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  35.22 
 
 		 165 aa  100  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  29.14 
 
 		 363 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  35.53 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  25.17 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  25.17 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  22.64 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.76 
 
 		 359 aa  40.8  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  22.86 
 
 		 150 aa  40.8  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  25.17 
 
 		 153 aa  40.8  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>