59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1254 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  100 
 
 		 359 aa  711    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  48.52 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  48.47 
 
 		 358 aa  288  1e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  47.9 
 
 		 352 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1655  hypothetical protein  70.65 
 
 		 96 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.81 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1504  Linocin_M18 bacteriocin protein  29.01 
 
 		 270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3018  Linocin_M18 bacteriocin protein  30.08 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0417  Linocin_M18 bacteriocin protein  28.08 
 
 		 264 aa  97.1  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0119  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.91 
 
 		 278 aa  96.3  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1705  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.38 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0890  hypothetical protein  54.64 
 
 		 94 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000110299  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1095  Linocin_M18 bacteriocin protein  28.23 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.236732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4282  Linocin_M18 bacteriocin protein  28.52 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2772  methyltransferase  51.06 
 
 		 94 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0196615  normal  0.0450388 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1010  hypothetical protein  48.78 
 
 		 101 aa  74.7  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1211  hypothetical protein  51.43 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000304169  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1283  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.91 
 
 		 263 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0692096  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0627  hypothetical protein  55.07 
 
 		 101 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1164  hypothetical protein  48.15 
 
 		 102 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527792  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2056  hypothetical protein  44.71 
 
 		 123 aa  70.5  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2055  hypothetical protein  46.34 
 
 		 114 aa  70.5  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4294  hypothetical protein  47.5 
 
 		 102 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00503085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1061  hypothetical protein  47.06 
 
 		 102 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2029  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1316  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.28 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600572  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1800  hypothetical protein  48 
 
 		 102 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463849  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0482  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0449183 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0817  hypothetical protein  51.52 
 
 		 101 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0856  hypothetical protein  48 
 
 		 102 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.354631  hitchhiker  0.0042327 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3055  hypothetical protein  45.71 
 
 		 112 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7404  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0884  Rubrerythrin  46.59 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00115612  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1503  hypothetical protein  47.5 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2827  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0207  methyltransferase  51.52 
 
 		 99 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0416  hypothetical protein  40.7 
 
 		 122 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1148  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2360  hypothetical protein  42.35 
 
 		 100 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2998  hypothetical protein  46.27 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3017  hypothetical protein  42.68 
 
 		 123 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.85648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1933  hypothetical protein  46.27 
 
 		 101 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15970  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.62 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1064  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0098  hypothetical protein  44.3 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0221803  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1094  hypothetical protein  43.75 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_108  hypothetical protein  43.04 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0270  hypothetical protein  43.04 
 
 		 102 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1284  hypothetical protein  41.25 
 
 		 132 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0184871  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2114  hypothetical protein  44 
 
 		 91 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00651332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2248  Linocin_M18 bacteriocin protein  29.05 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00352886  decreased coverage  0.00701181 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1533  hypothetical protein  43.08 
 
 		 107 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000142155  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4139  uncharacterized protein linocin/CFP29  28.42 
 
 		 272 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.101347  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5123  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.69 
 
 		 265 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  0.576043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3202  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.26 
 
 		 265 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.579175  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  42.11 
 
 		 165 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4015  Linocin_M18 bacteriocin protein  25 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1065  hypothetical protein  34.21 
 
 		 89 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0002  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.35 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000133397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  41.82 
 
 		 165 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>